103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0442 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0442  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  925    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7231  type III effector Hrp-dependent outers  87.64 
 
 		 448 aa  772    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  52.02 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1944  type III effector Hrp-dependent outers  52.12 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  37.66 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  37.23 
 
 		 469 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  36.6 
 
 		 463 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  37.53 
 
 		 448 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  38.39 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5258  type III effector Hrp-dependent outer  35.09 
 
 		 469 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  35.98 
 
 		 444 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  37.15 
 
 		 469 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  37.12 
 
 		 455 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  35.68 
 
 		 448 aa  222  9e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  37.07 
 
 		 474 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  36.74 
 
 		 457 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3121  type III effector Hrp-dependent outers  32.89 
 
 		 437 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404203 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1068  type III effector Hrp-dependent outer protein  35.68 
 
 		 463 aa  210  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  35.67 
 
 		 432 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1733  type III effector Hrp-dependent outers  37.31 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1449  type III effector Hrp-dependent outers  34.09 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2027  type III effector Hrp-dependent outers  34.09 
 
 		 428 aa  177  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3217  type III effector Hrp-dependent outers  33.63 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  33.62 
 
 		 429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1738  type III effector Hrp-dependent outers  33.48 
 
 		 431 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0119414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  29.93 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  29.01 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  27.56 
 
 		 427 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  31.18 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  28.09 
 
 		 423 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  29.27 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  29.27 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  29.27 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  29.56 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  28.89 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  29.44 
 
 		 432 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  29.91 
 
 		 419 aa  99.8  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  28.19 
 
 		 423 aa  99  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  28.95 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  30.18 
 
 		 422 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  28.6 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  30.92 
 
 		 437 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  28.67 
 
 		 426 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  28.17 
 
 		 429 aa  94  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  28.6 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  26.83 
 
 		 425 aa  91.3  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  32.26 
 
 		 511 aa  90.5  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  28.67 
 
 		 427 aa  90.5  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  25.78 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  28.03 
 
 		 425 aa  89.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  26.85 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  28.08 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  26.99 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  26.67 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  29.8 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  26.23 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  28.64 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  29.15 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  27.03 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  25.06 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  28.38 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  27.35 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  25.81 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  26.48 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  30.09 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  24.33 
 
 		 430 aa  76.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  28.09 
 
 		 447 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  26.48 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  25.96 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  27.04 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  27.25 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  25.77 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  27.43 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  26.23 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  26.58 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  27.62 
 
 		 455 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  27.62 
 
 		 455 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  27.62 
 
 		 455 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  27.62 
 
 		 463 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  26.22 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  26.22 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  25.45 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  25.23 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  25.23 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  27.05 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  25.56 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  27.27 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  25.23 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  26.19 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  26.22 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  26.17 
 
 		 437 aa  67  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25.11 
 
 		 572 aa  67  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  27.65 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  30.91 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  30.91 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  30.91 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  25 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  25.12 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  26.36 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  22.17 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>