131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4551 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  77.9 
 
 		 455 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  77.9 
 
 		 455 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  91.67 
 
 		 433 aa  771    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  79.96 
 
 		 447 aa  692    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  76.43 
 
 		 436 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  93.52 
 
 		 433 aa  800    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 432 aa  861    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  93.52 
 
 		 433 aa  800    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  79.29 
 
 		 447 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  78.12 
 
 		 455 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  77.9 
 
 		 455 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  76.56 
 
 		 463 aa  668    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  88.66 
 
 		 428 aa  751    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  93.29 
 
 		 433 aa  797    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  97.45 
 
 		 432 aa  825    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  79.09 
 
 		 439 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  76.31 
 
 		 436 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  76.47 
 
 		 432 aa  631  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  73.58 
 
 		 422 aa  609  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  74.41 
 
 		 432 aa  611  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  69.28 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  69.95 
 
 		 437 aa  571  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  69.83 
 
 		 437 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  68.63 
 
 		 404 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  59.14 
 
 		 425 aa  488  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  59.58 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  62.24 
 
 		 427 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  61.31 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  59.53 
 
 		 423 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  58.78 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  56.84 
 
 		 422 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  58.35 
 
 		 422 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  53.54 
 
 		 419 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  46.89 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  55.48 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  53.59 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  52.69 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  46.65 
 
 		 413 aa  373  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  45.69 
 
 		 418 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  47.29 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  47.06 
 
 		 424 aa  365  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  46.32 
 
 		 420 aa  359  7e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  48.34 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  48.82 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  48.72 
 
 		 425 aa  352  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  47.26 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  49.41 
 
 		 425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  50.71 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  45.02 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  45.02 
 
 		 420 aa  342  5e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  45.02 
 
 		 420 aa  342  5e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  46.54 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  45.02 
 
 		 420 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  44.81 
 
 		 420 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  44.81 
 
 		 420 aa  338  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  44.81 
 
 		 420 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  44.81 
 
 		 420 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  49.17 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  44.58 
 
 		 420 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  48.1 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  44.64 
 
 		 390 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  44.22 
 
 		 388 aa  312  9e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  42.27 
 
 		 511 aa  302  9e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  51.29 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  46.12 
 
 		 396 aa  299  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  45.35 
 
 		 434 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  45.35 
 
 		 434 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  45.12 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  46.59 
 
 		 416 aa  282  7.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  42.58 
 
 		 466 aa  276  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  42.72 
 
 		 417 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  32.31 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  31.85 
 
 		 474 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  30.79 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  27.37 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  29.98 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0442  hypothetical protein  29.93 
 
 		 460 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  27.47 
 
 		 461 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  26.52 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1068  type III effector Hrp-dependent outer protein  30.94 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  30.09 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7231  type III effector Hrp-dependent outers  29.57 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  27.85 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  29.95 
 
 		 444 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  29.57 
 
 		 429 aa  97.4  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  29.72 
 
 		 458 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  29.36 
 
 		 262 aa  96.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  30.46 
 
 		 455 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  27.78 
 
 		 448 aa  96.3  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  33.95 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  29.62 
 
 		 469 aa  94  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  26.74 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1944  type III effector Hrp-dependent outers  30.15 
 
 		 454 aa  90.1  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  25.65 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  25.65 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  26.42 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  25.65 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  30.54 
 
 		 422 aa  87  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5258  type III effector Hrp-dependent outer  26.99 
 
 		 469 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3121  type III effector Hrp-dependent outers  26.05 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404203 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>