136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1458 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  99.54 
 
 
434 aa  885    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  889    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  99.31 
 
 
434 aa  883    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  47.32 
 
 
417 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  49.31 
 
 
424 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  49.3 
 
 
420 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  48.15 
 
 
424 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  47.44 
 
 
418 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  45.69 
 
 
424 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  45.69 
 
 
424 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  47.33 
 
 
420 aa  360  4e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  48.03 
 
 
420 aa  359  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  47.33 
 
 
420 aa  358  8e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  47.33 
 
 
420 aa  358  8e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  46.01 
 
 
413 aa  354  1e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  46.87 
 
 
420 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  46.87 
 
 
420 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  46.87 
 
 
420 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  46.87 
 
 
420 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  46.64 
 
 
420 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  47.28 
 
 
390 aa  336  5e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  45.9 
 
 
429 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  42.76 
 
 
425 aa  323  5e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  46.62 
 
 
388 aa  322  7e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  46.96 
 
 
432 aa  317  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  44.94 
 
 
422 aa  306  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  45.12 
 
 
432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  44.73 
 
 
428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  45.71 
 
 
419 aa  302  9e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  44.99 
 
 
433 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  44.99 
 
 
433 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  44.99 
 
 
433 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  44.18 
 
 
447 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  44.72 
 
 
423 aa  299  6e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  45.22 
 
 
433 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  44.58 
 
 
404 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  42.95 
 
 
436 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  42.79 
 
 
439 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  44.62 
 
 
427 aa  292  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  44.11 
 
 
423 aa  292  8e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  42.4 
 
 
432 aa  292  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  44.65 
 
 
432 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  44.49 
 
 
447 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  44.42 
 
 
437 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  44.03 
 
 
437 aa  289  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  42.66 
 
 
422 aa  288  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  43.72 
 
 
455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  43.72 
 
 
455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  43.72 
 
 
455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  42.98 
 
 
463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  40.88 
 
 
426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  43.51 
 
 
455 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  41.55 
 
 
422 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  42.03 
 
 
423 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  41.59 
 
 
427 aa  280  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  42.76 
 
 
436 aa  279  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  41.96 
 
 
437 aa  276  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  41.3 
 
 
424 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  38.71 
 
 
426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  43.62 
 
 
422 aa  270  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  37.53 
 
 
425 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  39.81 
 
 
426 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  43.88 
 
 
418 aa  256  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  38.71 
 
 
425 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  38.89 
 
 
511 aa  243  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  36.57 
 
 
426 aa  236  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  38.6 
 
 
466 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  38.46 
 
 
424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  38.42 
 
 
396 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  37.64 
 
 
416 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  37.13 
 
 
417 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  27.65 
 
 
419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  28.03 
 
 
469 aa  123  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  28.19 
 
 
474 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  30.45 
 
 
457 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5258  type III effector Hrp-dependent outer  26.1 
 
 
469 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69157  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  26.64 
 
 
461 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  29.05 
 
 
449 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  28.25 
 
 
432 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25 
 
 
572 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  24.83 
 
 
572 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  30.79 
 
 
458 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  27.72 
 
 
422 aa  96.7  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3217  type III effector Hrp-dependent outers  29.54 
 
 
442 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  27.18 
 
 
469 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  26.11 
 
 
432 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  26.79 
 
 
463 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  27.29 
 
 
448 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  23.97 
 
 
572 aa  90.1  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  25.7 
 
 
455 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  26.8 
 
 
381 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  25.82 
 
 
423 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  27.57 
 
 
448 aa  84  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  26.22 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  25.82 
 
 
423 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  25.82 
 
 
423 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  28.35 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  25.82 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1944  type III effector Hrp-dependent outers  28.22 
 
 
454 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  25.68 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>