131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3730 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 417 aa  798    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  39.44 
 
 		 417 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  46.53 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  43.65 
 
 		 429 aa  279  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  43.95 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  46.71 
 
 		 416 aa  276  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  43.19 
 
 		 423 aa  275  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  45.18 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  44.57 
 
 		 433 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  44.57 
 
 		 433 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  44.57 
 
 		 433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  40.74 
 
 		 425 aa  273  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  42.36 
 
 		 427 aa  272  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  44.24 
 
 		 447 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  43.75 
 
 		 432 aa  272  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  42.79 
 
 		 422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  44.75 
 
 		 439 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  43.75 
 
 		 427 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  44.06 
 
 		 423 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  43.19 
 
 		 432 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  43.49 
 
 		 428 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  43.85 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  39.86 
 
 		 420 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  39.86 
 
 		 420 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  39.86 
 
 		 420 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  39.86 
 
 		 420 aa  262  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  44.04 
 
 		 447 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  42.92 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  42.92 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  42.92 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  38.97 
 
 		 424 aa  259  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  42.49 
 
 		 432 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  37.83 
 
 		 413 aa  258  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  37.53 
 
 		 424 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  42.89 
 
 		 455 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  42.17 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  42.82 
 
 		 432 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  44.16 
 
 		 436 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  39.2 
 
 		 420 aa  256  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  38.73 
 
 		 424 aa  255  8e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  39.86 
 
 		 420 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  39.86 
 
 		 420 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  39.86 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  39.86 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  39.86 
 
 		 420 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  38.5 
 
 		 418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  44.5 
 
 		 422 aa  253  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  38.02 
 
 		 424 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  41.83 
 
 		 404 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  39.95 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  43.75 
 
 		 425 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  39.84 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  44.73 
 
 		 437 aa  237  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  41.59 
 
 		 422 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  42.03 
 
 		 437 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  39.17 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  38.93 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  39.39 
 
 		 426 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  41.41 
 
 		 437 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  35.45 
 
 		 434 aa  226  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  35.45 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  35.45 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  41.2 
 
 		 423 aa  222  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  41.28 
 
 		 424 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  39.95 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  40.92 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  41.3 
 
 		 396 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  43.02 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  38.59 
 
 		 424 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  49.77 
 
 		 466 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  30.7 
 
 		 419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  32.25 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  32.25 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  32.25 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  32.25 
 
 		 423 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  26.84 
 
 		 469 aa  96.7  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  31.99 
 
 		 427 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  29.57 
 
 		 572 aa  94.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  35.21 
 
 		 572 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  34.74 
 
 		 572 aa  89.7  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  29.44 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  30.02 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  26.75 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  30.73 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1449  type III effector Hrp-dependent outers  31.74 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0524  hypothetical protein  26.14 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000260703 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  27.9 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  27.33 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2027  type III effector Hrp-dependent outers  31.51 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0442  hypothetical protein  28.34 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  39.04 
 
 		 511 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  31.41 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  34.56 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  31.16 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7231  type III effector Hrp-dependent outers  29.67 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3217  type III effector Hrp-dependent outers  26.92 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  27.87 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3263  type III effector Hrp-dependent outers  33.41 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.197433  normal  0.0349209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  31.44 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>