129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1552 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 466 aa  908    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  52.35 
 
 		 511 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  45.81 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  43.71 
 
 		 423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  38.63 
 
 		 417 aa  313  5.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  44.64 
 
 		 432 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  42.58 
 
 		 423 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  39.87 
 
 		 418 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  43.89 
 
 		 432 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  43.41 
 
 		 427 aa  307  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  43.11 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  44.23 
 
 		 422 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  43.07 
 
 		 436 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  43.01 
 
 		 433 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  43.01 
 
 		 433 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  43.01 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  43.36 
 
 		 422 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  38.11 
 
 		 413 aa  300  4e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  43.01 
 
 		 433 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  43.94 
 
 		 439 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  41.16 
 
 		 427 aa  299  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  43.67 
 
 		 432 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  41.99 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  42.02 
 
 		 447 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  41.99 
 
 		 424 aa  295  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  40.88 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  40.96 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  42.37 
 
 		 437 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  40.26 
 
 		 424 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  44.81 
 
 		 422 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  43.41 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  41.01 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  39.18 
 
 		 425 aa  287  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  39.87 
 
 		 420 aa  285  9e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  43.45 
 
 		 437 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  41.3 
 
 		 447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  39.87 
 
 		 420 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  39.87 
 
 		 420 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  39.65 
 
 		 420 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  40.62 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  40.62 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  40.62 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  40.62 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  39.29 
 
 		 420 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  39.29 
 
 		 420 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  41.01 
 
 		 423 aa  277  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  39.96 
 
 		 463 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  39.29 
 
 		 420 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  41.74 
 
 		 404 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  39.07 
 
 		 420 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  39.07 
 
 		 420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  44.06 
 
 		 437 aa  269  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  41.54 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  39.39 
 
 		 390 aa  262  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  39.65 
 
 		 425 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  42.11 
 
 		 424 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  39.78 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  40.13 
 
 		 422 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  38.48 
 
 		 426 aa  256  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  39.71 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  41.65 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  40.22 
 
 		 425 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  40.66 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  38.29 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  38.29 
 
 		 434 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  38.51 
 
 		 434 aa  243  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  40.66 
 
 		 426 aa  240  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  39.01 
 
 		 416 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  43.79 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  39.06 
 
 		 417 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  39.39 
 
 		 424 aa  195  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  30.71 
 
 		 419 aa  161  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  28.28 
 
 		 432 aa  107  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  29.75 
 
 		 474 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  34.48 
 
 		 427 aa  100  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  37.95 
 
 		 381 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  26.65 
 
 		 461 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  23.89 
 
 		 469 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  29.47 
 
 		 262 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  31.6 
 
 		 572 aa  85.1  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0442  hypothetical protein  27.38 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  25.97 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3217  type III effector Hrp-dependent outers  27.33 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  27.31 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  27.31 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  27.31 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  26.97 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  27.31 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  29.91 
 
 		 572 aa  80.9  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1449  type III effector Hrp-dependent outers  27.48 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2027  type III effector Hrp-dependent outers  27.48 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  29.44 
 
 		 572 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  28.57 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  35.41 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  31.02 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  29.98 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1944  type III effector Hrp-dependent outers  27.16 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7231  type III effector Hrp-dependent outers  28.03 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  30.49 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  34.35 
 
 		 432 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>