130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5156 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  79.21 
 
 		 455 aa  684    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  79.21 
 
 		 455 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  97 
 
 		 433 aa  820    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  81.29 
 
 		 447 aa  705    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  78.49 
 
 		 436 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 433 aa  858    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  93.52 
 
 		 432 aa  800    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 433 aa  858    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  80.62 
 
 		 447 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  79.43 
 
 		 455 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  79.21 
 
 		 455 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  77.85 
 
 		 463 aa  680    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  90.51 
 
 		 428 aa  768    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  99.31 
 
 		 433 aa  853    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  91.9 
 
 		 432 aa  772    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  79.09 
 
 		 439 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  77.27 
 
 		 436 aa  669    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  74.82 
 
 		 432 aa  618  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  74.41 
 
 		 432 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  73.11 
 
 		 422 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  69.98 
 
 		 429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  69.25 
 
 		 437 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  68.88 
 
 		 437 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  69.12 
 
 		 404 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  58.43 
 
 		 425 aa  481  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  62.24 
 
 		 423 aa  472  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  59.63 
 
 		 427 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  62 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  59.53 
 
 		 423 aa  458  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  58.08 
 
 		 423 aa  441  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  56.37 
 
 		 422 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  56.09 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  48.09 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  54.01 
 
 		 419 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  55.95 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  47.02 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  53.16 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  46.41 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  52.15 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  47.53 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  47.53 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  47.27 
 
 		 420 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  48.45 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  47.63 
 
 		 426 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  47.97 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  48.36 
 
 		 425 aa  352  5.9999999999999994e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  47.87 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  45.39 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  45.75 
 
 		 420 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  45.39 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  45.39 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  45.75 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  45.75 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  45.75 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  48.69 
 
 		 425 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  45.39 
 
 		 420 aa  342  9e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  45.52 
 
 		 420 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  49.52 
 
 		 426 aa  332  6e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  48.59 
 
 		 426 aa  332  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  48.57 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  45.27 
 
 		 390 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  44.85 
 
 		 388 aa  312  9e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  51.06 
 
 		 418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  43.68 
 
 		 511 aa  302  9e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  46.12 
 
 		 396 aa  300  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  45.35 
 
 		 434 aa  289  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  45.35 
 
 		 434 aa  289  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  45.12 
 
 		 434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  47.94 
 
 		 416 aa  285  8e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  41.48 
 
 		 466 aa  273  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  44.11 
 
 		 417 aa  246  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  32.55 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  32.41 
 
 		 474 aa  126  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  31.53 
 
 		 448 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  27.94 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  30.29 
 
 		 432 aa  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  30.37 
 
 		 457 aa  106  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  29.75 
 
 		 429 aa  104  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0442  hypothetical protein  29.27 
 
 		 460 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1068  type III effector Hrp-dependent outer protein  30.15 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  26.43 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  30.54 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  31.13 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  26.27 
 
 		 461 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  29.64 
 
 		 469 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7231  type III effector Hrp-dependent outers  27.63 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  25.11 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  26.62 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  29.98 
 
 		 458 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  29.81 
 
 		 262 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  27.05 
 
 		 448 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  26.88 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  26.88 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  26.88 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3121  type III effector Hrp-dependent outers  26.74 
 
 		 437 aa  90.5  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404203 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  26.88 
 
 		 423 aa  90.1  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5258  type III effector Hrp-dependent outer  27.21 
 
 		 469 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1944  type III effector Hrp-dependent outers  29.74 
 
 		 454 aa  87  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1733  type III effector Hrp-dependent outers  30.82 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  30.08 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>