105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2027 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2027  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 428 aa  832    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1449  type III effector Hrp-dependent outers  99.77 
 
 		 428 aa  830    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1738  type III effector Hrp-dependent outers  62.94 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0119414 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  33.78 
 
 		 448 aa  195  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1068  type III effector Hrp-dependent outer protein  39.56 
 
 		 463 aa  193  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3217  type III effector Hrp-dependent outers  36.81 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  35.97 
 
 		 448 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1944  type III effector Hrp-dependent outers  37.86 
 
 		 454 aa  183  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  31.07 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  33.19 
 
 		 469 aa  180  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7231  type III effector Hrp-dependent outers  32.74 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  30.85 
 
 		 469 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5258  type III effector Hrp-dependent outer  30.97 
 
 		 469 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  35.15 
 
 		 444 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  33.86 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0442  hypothetical protein  33.86 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  35.84 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  34.23 
 
 		 457 aa  173  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  35.81 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  32.03 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  33.04 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  33.26 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1733  type III effector Hrp-dependent outers  34.91 
 
 		 452 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  35.03 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3121  type III effector Hrp-dependent outers  27.35 
 
 		 437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  33.03 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  28.14 
 
 		 423 aa  94.4  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  31.1 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  29.38 
 
 		 429 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  25.4 
 
 		 413 aa  86.3  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  28.67 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  25.78 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  28.6 
 
 		 422 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  31.42 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  28.7 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  29.75 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  25.62 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  29.89 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  31.82 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  32.35 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  25.56 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  28.93 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  29.22 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  27.54 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  28.18 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  28.23 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  28.96 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  28.96 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  28.96 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  26.67 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  29.02 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  26.96 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  28.04 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  28.35 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  28.05 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  29.14 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  28.44 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  27.63 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  27.94 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  27.43 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  27.43 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  26.79 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  29.29 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  27.43 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  26.37 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  26.75 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  24.66 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  28.7 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  27.78 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  26.01 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  26.61 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  25.84 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  25.84 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  26.38 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  26.61 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  27.12 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  26.82 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  27.99 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  26.73 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  29.05 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  26.46 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  27.35 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  26.62 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  26.88 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  26.88 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  26.49 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  26.88 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  28.12 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  28.34 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  28.41 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  27.68 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  24.3 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  29.32 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  32.13 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  21.89 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  26.18 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  30.42 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  30.66 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  24.43 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  27.41 
 
 		 423 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>