108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5258 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5258  type III effector Hrp-dependent outer  100 
 
 		 469 aa  949    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  56.89 
 
 		 469 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  50 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  39.01 
 
 		 461 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  39.83 
 
 		 469 aa  322  7e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  40.76 
 
 		 474 aa  310  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  41.5 
 
 		 455 aa  309  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  41.45 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  41.99 
 
 		 448 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  41.45 
 
 		 444 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  41.52 
 
 		 458 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1068  type III effector Hrp-dependent outer protein  41.29 
 
 		 463 aa  282  9e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1733  type III effector Hrp-dependent outers  44.08 
 
 		 452 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  39 
 
 		 449 aa  276  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  39.36 
 
 		 448 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  37.28 
 
 		 432 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  39.69 
 
 		 429 aa  249  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3121  type III effector Hrp-dependent outers  35.31 
 
 		 437 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404203 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7231  type III effector Hrp-dependent outers  34.86 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1944  type III effector Hrp-dependent outers  36.62 
 
 		 454 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0442  hypothetical protein  34.65 
 
 		 460 aa  232  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3217  type III effector Hrp-dependent outers  31.83 
 
 		 442 aa  202  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2027  type III effector Hrp-dependent outers  30.97 
 
 		 428 aa  176  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1449  type III effector Hrp-dependent outers  30.97 
 
 		 428 aa  176  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1738  type III effector Hrp-dependent outers  30.46 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0119414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  27.01 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  26.1 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  26.1 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  26.1 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  27.47 
 
 		 419 aa  97.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  24.19 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  25.74 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  25.76 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  24.83 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  26.24 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  26.65 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  25.64 
 
 		 425 aa  91.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  26.65 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  28.04 
 
 		 428 aa  91.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  25.33 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  27.33 
 
 		 422 aa  90.5  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  27.43 
 
 		 432 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  28.48 
 
 		 423 aa  90.1  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  26.77 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  27.21 
 
 		 433 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  27.21 
 
 		 433 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  27.21 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  27.21 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  25.88 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  25.82 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  25.66 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  25.66 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  27.74 
 
 		 425 aa  87.8  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  26.99 
 
 		 432 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  26.77 
 
 		 423 aa  86.7  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  24.61 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  27.21 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  26.94 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  27.75 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  27.01 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  25.56 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  27.68 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  27.96 
 
 		 396 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  26.44 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  26.32 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  26.01 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  24.67 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  24.45 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  24.45 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  24.45 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  24.78 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  26.23 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  26.98 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  26.65 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  24.65 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  26.99 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  24.45 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  25.05 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  26.75 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  25.16 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  30.28 
 
 		 511 aa  71.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  30.32 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  26.51 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  26.51 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  26.93 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  26.51 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  24.73 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  24.73 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  24.73 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  24.73 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  25.49 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  26.59 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  26.08 
 
 		 463 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  25.92 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  23.87 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  23.71 
 
 		 422 aa  55.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  23.83 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  23.9 
 
 		 388 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  25 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  23.53 
 
 		 572 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>