125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5061 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  100 
 
 		 404 aa  803    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  97.28 
 
 		 429 aa  781    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  70.79 
 
 		 432 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  70.27 
 
 		 428 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  68.6 
 
 		 439 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  69.12 
 
 		 433 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  69.12 
 
 		 433 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  69.36 
 
 		 433 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  67.8 
 
 		 436 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  69 
 
 		 422 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  68.63 
 
 		 432 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  69.61 
 
 		 433 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  67.22 
 
 		 447 aa  528  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  67.96 
 
 		 436 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  68.14 
 
 		 432 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  66.18 
 
 		 432 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  66.04 
 
 		 447 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  64.81 
 
 		 455 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  64.81 
 
 		 455 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  64.81 
 
 		 455 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  64.81 
 
 		 455 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  63.64 
 
 		 463 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  65.84 
 
 		 437 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  64.32 
 
 		 437 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  56.82 
 
 		 425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  56.44 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  57.88 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  56.72 
 
 		 427 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  54.63 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  53.06 
 
 		 423 aa  381  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  52.3 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  48.4 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  51.74 
 
 		 422 aa  364  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  48.4 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  46.88 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  52.09 
 
 		 419 aa  351  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  47.76 
 
 		 418 aa  346  5e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  49.13 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  45.61 
 
 		 413 aa  339  7e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  48.88 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  43.88 
 
 		 420 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  43.88 
 
 		 420 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  43.65 
 
 		 420 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  44.25 
 
 		 420 aa  330  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  47.67 
 
 		 425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  48.13 
 
 		 422 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  49.13 
 
 		 437 aa  315  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  42.65 
 
 		 420 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  42.47 
 
 		 420 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  42.47 
 
 		 420 aa  312  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  42.47 
 
 		 420 aa  312  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  49.38 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  42.22 
 
 		 420 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  43.78 
 
 		 420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  44.83 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  45.32 
 
 		 426 aa  305  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  43.38 
 
 		 390 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  43.19 
 
 		 388 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  46.31 
 
 		 426 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  44.28 
 
 		 425 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  47.73 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  45.27 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  44.83 
 
 		 434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  44.83 
 
 		 434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  44.58 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  42.64 
 
 		 396 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  48.75 
 
 		 418 aa  272  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  44.78 
 
 		 424 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  40.36 
 
 		 511 aa  259  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  39.73 
 
 		 466 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  41.83 
 
 		 417 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  30.84 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  32.47 
 
 		 429 aa  120  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  28.8 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  26.29 
 
 		 469 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  29 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  28.88 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  28.6 
 
 		 448 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  26.79 
 
 		 463 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  28.14 
 
 		 455 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  28.5 
 
 		 444 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  27.82 
 
 		 469 aa  93.6  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  27.46 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  28.08 
 
 		 381 aa  87  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25.25 
 
 		 572 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25.75 
 
 		 572 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25 
 
 		 572 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  27.27 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  28.72 
 
 		 262 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  26.16 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1449  type III effector Hrp-dependent outers  29.75 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2027  type III effector Hrp-dependent outers  29.75 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  26.33 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  29.32 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  29.46 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  26.33 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  26.33 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1068  type III effector Hrp-dependent outer protein  28.26 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  26.33 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5258  type III effector Hrp-dependent outer  24.65 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>