131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2422 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 
381 aa  743    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  34.43 
 
 
430 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  33.73 
 
 
427 aa  189  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  38.96 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  32.31 
 
 
423 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  32.31 
 
 
423 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  32.55 
 
 
423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  32.31 
 
 
423 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  32 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  33.74 
 
 
425 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  33.74 
 
 
425 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  33.09 
 
 
425 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  26.56 
 
 
572 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  32.3 
 
 
428 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  26.29 
 
 
572 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  26.52 
 
 
409 aa  117  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  32.16 
 
 
427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  26.7 
 
 
572 aa  116  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  29.57 
 
 
432 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  30.34 
 
 
439 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3536  type III effector Hrp-dependent outers  29.82 
 
 
442 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  29.25 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  32.14 
 
 
410 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8221  type III effector Hrp-dependent outers  32.08 
 
 
399 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  28.4 
 
 
262 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3263  type III effector Hrp-dependent outers  31.28 
 
 
454 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.197433  normal  0.0349209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  24.06 
 
 
417 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0564  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  33 
 
 
770 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.432239 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  29.15 
 
 
432 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  29.15 
 
 
423 aa  99.4  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  27.85 
 
 
432 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  29.25 
 
 
429 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  23.42 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  28.3 
 
 
432 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  28.99 
 
 
428 aa  96.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  26.54 
 
 
425 aa  95.1  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3566  hypothetical protein  28.32 
 
 
409 aa  93.2  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00898441  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  27.85 
 
 
437 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  26.62 
 
 
433 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  26.62 
 
 
433 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1143  hypothetical protein  30.67 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  26.3 
 
 
433 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  26.56 
 
 
433 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  25 
 
 
432 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  35.75 
 
 
455 aa  89.7  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  30.23 
 
 
440 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  26.52 
 
 
437 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  28.81 
 
 
422 aa  87  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1035  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  30.72 
 
 
792 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  26.81 
 
 
439 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  26.68 
 
 
436 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  28.08 
 
 
404 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8126  type III effector Hrp-dependent outers  29.32 
 
 
368 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302902  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3980  hypothetical protein  26.94 
 
 
353 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  28.16 
 
 
416 aa  86.3  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1466  type III effector Hrp-dependent outers  29.25 
 
 
366 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5836  hypothetical protein  27.91 
 
 
419 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.244996  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  38.32 
 
 
466 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  35.62 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  23.06 
 
 
424 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  27.32 
 
 
427 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  23.06 
 
 
424 aa  84  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  26.38 
 
 
423 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4366  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  31.22 
 
 
721 aa  82.8  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  25.68 
 
 
434 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  25.68 
 
 
434 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  29.84 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  22.93 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  26.25 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  27.62 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  25.45 
 
 
434 aa  80.1  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  26.34 
 
 
447 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  27.78 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  32.86 
 
 
424 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4643  hypothetical protein  29.85 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0336698  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  27.78 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  27.78 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  27.78 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  27.78 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  27.78 
 
 
420 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  25.7 
 
 
420 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2989  hypothetical protein  42.45 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.832553  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  28.74 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  34.3 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0918  hypothetical protein  25.07 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  23.65 
 
 
424 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  23.42 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  30.25 
 
 
455 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  30.25 
 
 
455 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1158  hypothetical protein  28.16 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178249  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  30.25 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  30.25 
 
 
455 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0524  hypothetical protein  23.5 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000260703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1102  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  30.28 
 
 
788 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  30.25 
 
 
455 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  30.25 
 
 
463 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  35.32 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  24.63 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  27.36 
 
 
425 aa  72.8  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  32.35 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>