134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1025 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 426 aa  825    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  69.88 
 
 		 425 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  71.06 
 
 		 422 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  67.76 
 
 		 426 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  70.13 
 
 		 396 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  67.06 
 
 		 426 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  68.71 
 
 		 424 aa  521  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  69.81 
 
 		 437 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  66.59 
 
 		 426 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  61.27 
 
 		 425 aa  494  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  60.85 
 
 		 424 aa  420  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  50.71 
 
 		 432 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  51.9 
 
 		 432 aa  361  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  49.88 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  46.45 
 
 		 425 aa  356  5e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  49.88 
 
 		 436 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  49.52 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  49.52 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  49.52 
 
 		 433 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  50.59 
 
 		 439 aa  349  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  49.76 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  50 
 
 		 432 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  49.28 
 
 		 422 aa  343  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  48.27 
 
 		 447 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  49.88 
 
 		 436 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  46.54 
 
 		 432 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  48.96 
 
 		 447 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  48.3 
 
 		 455 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  47.02 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  48.3 
 
 		 455 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  48.3 
 
 		 455 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  48.07 
 
 		 455 aa  329  7e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  46.39 
 
 		 427 aa  328  9e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  47.22 
 
 		 463 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  46.42 
 
 		 427 aa  322  6e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  46.7 
 
 		 437 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  48.45 
 
 		 422 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  46.93 
 
 		 423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  46.48 
 
 		 423 aa  319  6e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  46.51 
 
 		 437 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  43.59 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  43.68 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  45.41 
 
 		 423 aa  312  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  48 
 
 		 419 aa  307  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  43.43 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  40.48 
 
 		 413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  45.27 
 
 		 404 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  39.53 
 
 		 418 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  38.97 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  40.38 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  40.38 
 
 		 420 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  40.38 
 
 		 420 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  40.38 
 
 		 420 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  42.72 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  40.38 
 
 		 420 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  44.65 
 
 		 422 aa  283  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  42.24 
 
 		 424 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  39.95 
 
 		 420 aa  279  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  39.95 
 
 		 420 aa  279  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  39.72 
 
 		 420 aa  276  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  39.48 
 
 		 420 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  39.69 
 
 		 390 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  39.85 
 
 		 388 aa  259  9e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  41.04 
 
 		 511 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  37.73 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  37.73 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  45.41 
 
 		 418 aa  244  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  37.5 
 
 		 434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  40.88 
 
 		 466 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  42.43 
 
 		 416 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  40.37 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  33.49 
 
 		 419 aa  176  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  32.21 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  28.86 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  28.86 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  30.11 
 
 		 448 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  28.67 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  28.86 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  30.47 
 
 		 432 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  26.82 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  31.16 
 
 		 262 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  29.98 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  28.41 
 
 		 449 aa  98.2  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  32.69 
 
 		 410 aa  96.7  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  29.2 
 
 		 444 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  27.06 
 
 		 572 aa  96.3  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  29.03 
 
 		 422 aa  96.3  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  27.62 
 
 		 461 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  29.14 
 
 		 427 aa  93.2  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  32.28 
 
 		 455 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  28.04 
 
 		 469 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  29.14 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  25.05 
 
 		 463 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  26.8 
 
 		 448 aa  89.7  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7231  type III effector Hrp-dependent outers  28.92 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  25.17 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5258  type III effector Hrp-dependent outer  26.44 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  29.1 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0442  hypothetical protein  28.92 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  29.11 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>