109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0094 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 
457 aa  902    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  71.05 
 
 
458 aa  595  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  66.52 
 
 
474 aa  586  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  49.33 
 
 
455 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1068  type III effector Hrp-dependent outer protein  50.56 
 
 
463 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  47.01 
 
 
448 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  44.17 
 
 
448 aa  356  5.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  43.04 
 
 
469 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1733  type III effector Hrp-dependent outers  50.11 
 
 
452 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  47.23 
 
 
444 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  45.07 
 
 
432 aa  332  6e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  40.69 
 
 
461 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5258  type III effector Hrp-dependent outer  41.45 
 
 
469 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69157  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  39.08 
 
 
463 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  41.37 
 
 
469 aa  286  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3121  type III effector Hrp-dependent outers  36.57 
 
 
437 aa  279  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404203 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  42.89 
 
 
429 aa  270  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  42.2 
 
 
449 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1944  type III effector Hrp-dependent outers  39.5 
 
 
454 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7231  type III effector Hrp-dependent outers  38.04 
 
 
448 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0442  hypothetical protein  36.52 
 
 
460 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3217  type III effector Hrp-dependent outers  33.92 
 
 
442 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2027  type III effector Hrp-dependent outers  34.23 
 
 
428 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1449  type III effector Hrp-dependent outers  34.01 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  32.02 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1738  type III effector Hrp-dependent outers  32.21 
 
 
431 aa  128  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0119414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  32.28 
 
 
427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  31.99 
 
 
422 aa  126  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  29.5 
 
 
420 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  33.26 
 
 
427 aa  123  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  30.44 
 
 
436 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  31.82 
 
 
423 aa  113  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  30.42 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  31.07 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  29.12 
 
 
426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  28.05 
 
 
424 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  29.58 
 
 
436 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  30.11 
 
 
432 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  31.09 
 
 
433 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  31.09 
 
 
433 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  30.8 
 
 
433 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  28.76 
 
 
432 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  30.32 
 
 
422 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  27.83 
 
 
424 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  29.69 
 
 
437 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  31.39 
 
 
423 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  27.19 
 
 
425 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  29.78 
 
 
433 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  25.28 
 
 
417 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  30.77 
 
 
422 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  29.34 
 
 
434 aa  103  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  28.7 
 
 
420 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  28.38 
 
 
420 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  28.38 
 
 
420 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  28.38 
 
 
420 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  29.34 
 
 
434 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  29.34 
 
 
434 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  29.46 
 
 
437 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  29.12 
 
 
422 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  28.38 
 
 
420 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  27.83 
 
 
424 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  29.61 
 
 
432 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  28.12 
 
 
426 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  26.25 
 
 
418 aa  99.8  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  29.57 
 
 
425 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  27.6 
 
 
424 aa  98.6  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  30.44 
 
 
447 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  26.41 
 
 
425 aa  98.2  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  25.23 
 
 
413 aa  97.1  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  30.35 
 
 
455 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  30 
 
 
455 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  30.35 
 
 
455 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  29.95 
 
 
424 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  31.02 
 
 
455 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  28.38 
 
 
429 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  29.65 
 
 
447 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  31.02 
 
 
463 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  28.93 
 
 
511 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  28.05 
 
 
439 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  27.95 
 
 
420 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  27.95 
 
 
420 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  30.47 
 
 
396 aa  93.6  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  27.95 
 
 
420 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  27.05 
 
 
426 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  27.73 
 
 
420 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  28.88 
 
 
428 aa  90.1  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  28.22 
 
 
390 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  29.05 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  32.88 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.531117 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  27.94 
 
 
388 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  29.27 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  27.31 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  27.07 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  28.6 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  27.58 
 
 
466 aa  66.6  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  26.29 
 
 
572 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  28.78 
 
 
430 aa  61.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  25.68 
 
 
419 aa  57.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  24.94 
 
 
572 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  24.45 
 
 
572 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>