132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3038 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  79.67 
 
 
420 aa  686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  79.49 
 
 
390 aa  638    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  79.67 
 
 
420 aa  687    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  79.67 
 
 
420 aa  687    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  79.67 
 
 
420 aa  687    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  99.29 
 
 
420 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  99.52 
 
 
420 aa  859    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  99.76 
 
 
420 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  100 
 
 
420 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  99.76 
 
 
420 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  79.17 
 
 
388 aa  624  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  67.31 
 
 
420 aa  562  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  63.27 
 
 
424 aa  546  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  62.56 
 
 
424 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  59.43 
 
 
418 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  55.98 
 
 
417 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  58.71 
 
 
424 aa  480  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  58.71 
 
 
424 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  53.03 
 
 
413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  45.65 
 
 
425 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  48.81 
 
 
422 aa  365  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  44.92 
 
 
432 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  46.88 
 
 
422 aa  349  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  45.18 
 
 
436 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  47.74 
 
 
423 aa  347  3e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  45.75 
 
 
433 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  45.75 
 
 
433 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  45.75 
 
 
433 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  45.24 
 
 
428 aa  343  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  44.81 
 
 
432 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  43.84 
 
 
447 aa  338  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  45.52 
 
 
433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  45.35 
 
 
432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  43.71 
 
 
429 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  44.94 
 
 
436 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  46.87 
 
 
434 aa  334  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  43.43 
 
 
439 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  43.84 
 
 
447 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  45.61 
 
 
427 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  46.64 
 
 
434 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  46.64 
 
 
434 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  43.05 
 
 
455 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  43.05 
 
 
455 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  43.05 
 
 
455 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  43.05 
 
 
455 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  44.34 
 
 
432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  42.29 
 
 
463 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  44.58 
 
 
437 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  46.78 
 
 
423 aa  322  7e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  43.78 
 
 
437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  45.32 
 
 
423 aa  318  7.999999999999999e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  46.1 
 
 
427 aa  317  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  42.47 
 
 
404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  42.82 
 
 
422 aa  309  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  42.86 
 
 
437 aa  302  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  45.95 
 
 
422 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  40.28 
 
 
425 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  44.02 
 
 
419 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  42.52 
 
 
424 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  38.95 
 
 
426 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  40.62 
 
 
426 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  39.71 
 
 
426 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  40.28 
 
 
425 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  40.38 
 
 
426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  40.98 
 
 
416 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  40.39 
 
 
511 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  38.63 
 
 
466 aa  256  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  41.35 
 
 
424 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  43.1 
 
 
418 aa  249  9e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  39.32 
 
 
396 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  39.86 
 
 
417 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  30.24 
 
 
419 aa  177  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  27 
 
 
461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  27.39 
 
 
474 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  26.14 
 
 
469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  27.23 
 
 
422 aa  111  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  27.94 
 
 
457 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  28.98 
 
 
458 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  26.59 
 
 
429 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3121  type III effector Hrp-dependent outers  28.16 
 
 
437 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404203 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  26.65 
 
 
432 aa  97.8  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  31.43 
 
 
262 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  25.33 
 
 
463 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  28.05 
 
 
423 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  28.05 
 
 
423 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  28.29 
 
 
455 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  28.18 
 
 
423 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  28.05 
 
 
423 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  28.82 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  27.49 
 
 
469 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  27.21 
 
 
448 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  28.19 
 
 
572 aa  94.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  25.52 
 
 
430 aa  90.9  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  27.31 
 
 
449 aa  90.5  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  32.72 
 
 
427 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1068  type III effector Hrp-dependent outer protein  27.42 
 
 
463 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  26.67 
 
 
428 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  25.75 
 
 
448 aa  87.8  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3536  type III effector Hrp-dependent outers  25.28 
 
 
442 aa  86.7  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  31.88 
 
 
572 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>