115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1111 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  855    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  32.4 
 
 		 439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  33.74 
 
 		 423 aa  199  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  33.65 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  33.33 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  30.81 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  32.57 
 
 		 447 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  31.92 
 
 		 436 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  32.55 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  32.31 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  32.31 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  34.11 
 
 		 455 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  31.34 
 
 		 423 aa  190  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  32.57 
 
 		 447 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  33.85 
 
 		 455 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  33.85 
 
 		 455 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  32.33 
 
 		 436 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  33.85 
 
 		 455 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  33.85 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  31.99 
 
 		 432 aa  189  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  33.49 
 
 		 424 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  32.24 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  32.38 
 
 		 428 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  32.46 
 
 		 432 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  32.08 
 
 		 432 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  32.08 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  30.96 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  32.95 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  30.96 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  30.96 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  33.65 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  30.24 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  30.24 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  30.24 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  31.05 
 
 		 420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  30.24 
 
 		 420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  31.4 
 
 		 388 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  30.24 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  31.4 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  34.13 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  33.33 
 
 		 422 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  30.69 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  32.37 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  32.23 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  29.36 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  28.92 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  31.84 
 
 		 432 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  29.09 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  29.93 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  30 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  33.42 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  33.49 
 
 		 437 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  29.72 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  28.43 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  29.72 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  30.26 
 
 		 437 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  31.22 
 
 		 437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  31.21 
 
 		 426 aa  163  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  29.74 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  29.55 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  29.79 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  30.71 
 
 		 466 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  28.09 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  30.9 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  29.49 
 
 		 511 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  27.75 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  30 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  27.42 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  27.42 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  31.24 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  31.79 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  31.32 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  27.01 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  26.3 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25.13 
 
 		 572 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3217  type III effector Hrp-dependent outers  28.19 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  23.69 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1738  type III effector Hrp-dependent outers  24.88 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0119414 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  25.91 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  27.08 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7231  type III effector Hrp-dependent outers  26.22 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  23.4 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  25.68 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  24.27 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25.58 
 
 		 572 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  27.92 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2027  type III effector Hrp-dependent outers  24.94 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25.58 
 
 		 572 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  26.32 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  24.55 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1449  type III effector Hrp-dependent outers  24.77 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0442  hypothetical protein  24.74 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  24.71 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3536  type III effector Hrp-dependent outers  24.15 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  26.63 
 
 		 458 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  24.65 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  25.39 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5258  type III effector Hrp-dependent outer  23.36 
 
 		 469 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  27.03 
 
 		 474 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  25 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>