134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3536 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3536  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 442 aa  892    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  88.84 
 
 		 439 aa  740    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  60.92 
 
 		 422 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  60.97 
 
 		 428 aa  478  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  42.19 
 
 		 423 aa  312  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  42.19 
 
 		 423 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  42.42 
 
 		 423 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  42.19 
 
 		 423 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  29.23 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  31.81 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  29.98 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  32.38 
 
 		 425 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  32.38 
 
 		 425 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  29.87 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  28.57 
 
 		 430 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  29.82 
 
 		 381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  28.71 
 
 		 572 aa  126  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  27.07 
 
 		 572 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  27.32 
 
 		 572 aa  122  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0564  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  30.11 
 
 		 770 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.432239 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  27.87 
 
 		 409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  26.68 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  27.92 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3263  type III effector Hrp-dependent outers  30.37 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.197433  normal  0.0349209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  28.14 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8221  type III effector Hrp-dependent outers  28.05 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  30.5 
 
 		 262 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3566  hypothetical protein  30.25 
 
 		 409 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00898441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  31.67 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  31.36 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  24.37 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  26.97 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  25.89 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  27.78 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  26.54 
 
 		 420 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  26.32 
 
 		 420 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4366  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  29.36 
 
 		 721 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  26.32 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  26.32 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  25.28 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  25.28 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  25.28 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  25.28 
 
 		 420 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  25.28 
 
 		 420 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  25.62 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  26.57 
 
 		 390 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  25.75 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  27.77 
 
 		 424 aa  87.4  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  27.96 
 
 		 429 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1035  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  32.87 
 
 		 792 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  27.77 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  25.4 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  23.93 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  25.57 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2336  hypothetical protein  29.46 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  27.27 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  27.23 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5836  hypothetical protein  32.85 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.244996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  25.62 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  28.16 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1102  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  28.23 
 
 		 788 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  26.64 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  26.52 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  26.91 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  26.9 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  27.31 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  27.09 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  27.09 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  24.94 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  25.61 
 
 		 432 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  26.23 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  28.64 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  26.47 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  25 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  25.74 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  25.73 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  27.09 
 
 		 433 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2989  hypothetical protein  42.47 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.832553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  25.74 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  25.74 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  27.72 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  26.33 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  26.41 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  25.17 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  26.3 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  32.47 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  26.39 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  27.42 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  25 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  27.46 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  27.27 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  25.78 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  33.33 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  31.48 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  30.08 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  26.83 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  30.08 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  26.5 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  26.87 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  26.87 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>