154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0750 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  80.42 
 
 
572 aa  954    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  97.2 
 
 
572 aa  1108    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  100 
 
 
572 aa  1163    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  40.96 
 
 
262 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3142  PTS system glucitol/sorbitol-specific transporter subunit IIB  65.85 
 
 
323 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2953  glucitol/sorbitol-specific phosphotransferase enzyme iib component  65.85 
 
 
323 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3019  glucitol/sorbitol-specific phosphotransferase enzyme iib component  65.85 
 
 
323 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.824211  hitchhiker  0.00000475324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2984  glucitol/sorbitol-specific phosphotransferase enzyme iib component  65.85 
 
 
323 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3035  glucitol/sorbitol-specific phosphotransferase enzyme iib component  65.85 
 
 
323 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  hitchhiker  0.00564153 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3174  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIB component  69.03 
 
 
319 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2839  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIB component  68.18 
 
 
319 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1009  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIBC subunit  68.18 
 
 
319 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000525886 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0986  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIBC subunit  68.18 
 
 
319 aa  167  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.337304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2987  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIB component  68.18 
 
 
319 aa  167  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02553  glucitol/sorbitol-specific enzyme IIB component of PTS  68.18 
 
 
319 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.516594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02518  hypothetical protein  68.18 
 
 
319 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.660273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3570  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIBC subunit  63.72 
 
 
326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.944812 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2826  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIB component  68.14 
 
 
319 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.204454  hitchhiker  0.0000775819 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0678  PTS system, glucitol/sorbitol-specific IIBC component  62.39 
 
 
331 aa  160  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000916157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  28.86 
 
 
430 aa  145  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3263  type III effector Hrp-dependent outers  28.38 
 
 
454 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.197433  normal  0.0349209 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3331  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  49.21 
 
 
330 aa  130  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.624452  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  27.58 
 
 
423 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  26.57 
 
 
427 aa  126  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  27.35 
 
 
423 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  27.35 
 
 
423 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  27.35 
 
 
423 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  27.38 
 
 
422 aa  123  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  28.69 
 
 
455 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  26.17 
 
 
381 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4110  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  50 
 
 
327 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.603955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3775  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  49.21 
 
 
336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179423  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3536  type III effector Hrp-dependent outers  26.83 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  28.85 
 
 
440 aa  112  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  26.92 
 
 
429 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1064  PTS system, glucitol/sorbitol-specific, IIBC subunit  48.76 
 
 
333 aa  107  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  28.04 
 
 
439 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  29.03 
 
 
399 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  26.57 
 
 
424 aa  103  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  26.57 
 
 
424 aa  103  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2220  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  55.06 
 
 
334 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.447451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  25.91 
 
 
417 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  24.44 
 
 
439 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  24.61 
 
 
434 aa  96.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  25 
 
 
424 aa  97.1  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  25.84 
 
 
428 aa  96.3  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  24.61 
 
 
434 aa  96.3  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  24.61 
 
 
434 aa  96.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  25.11 
 
 
436 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  24.54 
 
 
424 aa  94  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  22.82 
 
 
409 aa  92.4  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  24.28 
 
 
416 aa  91.3  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  24.29 
 
 
425 aa  89.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  28.88 
 
 
424 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  28.84 
 
 
432 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  24.32 
 
 
425 aa  88.2  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  32.72 
 
 
511 aa  87.8  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  24.88 
 
 
418 aa  87.8  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  24.72 
 
 
428 aa  87  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  25.16 
 
 
413 aa  86.7  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  24.2 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  30.23 
 
 
423 aa  86.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  26.11 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  31.68 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  30.41 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2926  glucitol/sorbitol-specific phosphotransferase enzyme iib component  47.96 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  hitchhiker  0.0000393385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  31.68 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  31.68 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  31.68 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  31.19 
 
 
420 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  24.44 
 
 
425 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  24.44 
 
 
425 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  24.44 
 
 
425 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  25.78 
 
 
420 aa  83.2  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  24.39 
 
 
422 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  25.18 
 
 
433 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  25.42 
 
 
447 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  25.18 
 
 
433 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  25.18 
 
 
433 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  29.21 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  29.21 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  29.21 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  25.65 
 
 
455 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  25.65 
 
 
463 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  25.65 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  25.65 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  25.65 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  29.21 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  29.21 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  23.66 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  29.21 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  25.65 
 
 
447 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  26.94 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  23.25 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  30.73 
 
 
422 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  33.33 
 
 
419 aa  77  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  23.89 
 
 
427 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  24.5 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  27.25 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  30.14 
 
 
427 aa  74.7  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.403245 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>