138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2332 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 416 aa  802    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  44.55 
 
 		 425 aa  321  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  43.62 
 
 		 424 aa  315  9e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  49.3 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  43.62 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  47.43 
 
 		 423 aa  313  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  47.55 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  47.93 
 
 		 422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  48.37 
 
 		 432 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  47.59 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  45.41 
 
 		 432 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  47.58 
 
 		 433 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  47.58 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  47.58 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  46.4 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  41.88 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  48.06 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  46.59 
 
 		 437 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  40.1 
 
 		 413 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  46.22 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  41.51 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  46.08 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  47.45 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  44.68 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  42.11 
 
 		 424 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  46.59 
 
 		 437 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  46.21 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  46.35 
 
 		 432 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  42.15 
 
 		 420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  45.61 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  42.15 
 
 		 420 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  42.15 
 
 		 420 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  42.15 
 
 		 420 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  45.39 
 
 		 455 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  45.39 
 
 		 455 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  45.39 
 
 		 455 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  45.71 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  42.15 
 
 		 420 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  45.24 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  41.65 
 
 		 424 aa  280  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  44.61 
 
 		 463 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  45.75 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  42.69 
 
 		 420 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  41.57 
 
 		 420 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  44.19 
 
 		 419 aa  272  8.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  44.24 
 
 		 436 aa  272  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  45.62 
 
 		 427 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  41.34 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  41.34 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  41.34 
 
 		 420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  49.76 
 
 		 418 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  46.71 
 
 		 417 aa  256  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  41.23 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  40.9 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  42.72 
 
 		 422 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  42.09 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  42.89 
 
 		 511 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  41.86 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  44.08 
 
 		 437 aa  236  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  43.16 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  41.63 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  42.73 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  43.09 
 
 		 426 aa  229  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  37.33 
 
 		 434 aa  223  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  37.33 
 
 		 434 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  37.33 
 
 		 434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  42.2 
 
 		 426 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  39.54 
 
 		 425 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  39.02 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  38.86 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  40 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  30.93 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  29.74 
 
 		 427 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2027  type III effector Hrp-dependent outers  33.49 
 
 		 428 aa  103  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1449  type III effector Hrp-dependent outers  33.49 
 
 		 428 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  28.02 
 
 		 572 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  32.89 
 
 		 262 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  26.67 
 
 		 430 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  30.79 
 
 		 432 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  32.87 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25.72 
 
 		 572 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  33.26 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  31.04 
 
 		 474 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25.24 
 
 		 572 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  30.99 
 
 		 425 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  26.45 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1944  type III effector Hrp-dependent outers  29.84 
 
 		 454 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  28.73 
 
 		 449 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  29.25 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  30.7 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  29.25 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  26.75 
 
 		 461 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  28.88 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  30.88 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  27.75 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  27.88 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  27.75 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  27.75 
 
 		 423 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3217  type III effector Hrp-dependent outers  29.28 
 
 		 442 aa  86.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5836  hypothetical protein  32.44 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.244996  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>