143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1535 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 
425 aa  839    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 
425 aa  839    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  97.41 
 
 
425 aa  795    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  78.49 
 
 
427 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0564  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  56.29 
 
 
770 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.432239 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  43.1 
 
 
410 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3566  hypothetical protein  41.11 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00898441  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  39.95 
 
 
432 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5836  hypothetical protein  38.85 
 
 
419 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.244996  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  38.69 
 
 
416 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  32.15 
 
 
430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  34.46 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  33.74 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  31.32 
 
 
428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  30.94 
 
 
427 aa  123  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3536  type III effector Hrp-dependent outers  31.28 
 
 
442 aa  123  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4366  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  34.74 
 
 
721 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  30.54 
 
 
422 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  31.71 
 
 
439 aa  117  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  29 
 
 
423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  29 
 
 
423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  29.07 
 
 
423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  29.23 
 
 
423 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1035  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  31.1 
 
 
792 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2989  hypothetical protein  34.43 
 
 
390 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.832553  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  26.6 
 
 
425 aa  96.3  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  28.5 
 
 
423 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1102  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  31.89 
 
 
788 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  26.24 
 
 
409 aa  94  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  24.94 
 
 
417 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8126  type III effector Hrp-dependent outers  31.46 
 
 
368 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302902  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  33.45 
 
 
455 aa  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  31.21 
 
 
440 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  29.29 
 
 
422 aa  88.2  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  28.95 
 
 
422 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1466  type III effector Hrp-dependent outers  31.95 
 
 
366 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  28.5 
 
 
416 aa  86.3  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4643  hypothetical protein  33.1 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0336698  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3263  type III effector Hrp-dependent outers  29.95 
 
 
454 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.197433  normal  0.0349209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  24.1 
 
 
572 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  26.91 
 
 
572 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  27.02 
 
 
432 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8221  type III effector Hrp-dependent outers  27.45 
 
 
399 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  28.79 
 
 
262 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  24.7 
 
 
572 aa  83.2  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  28.5 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  25.92 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  27.46 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  25.87 
 
 
424 aa  79.7  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  27.17 
 
 
422 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  25.87 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2336  hypothetical protein  27.89 
 
 
448 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  28.8 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  27.36 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  27.27 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  27.59 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3980  hypothetical protein  27.9 
 
 
353 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  27.06 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1143  hypothetical protein  29.95 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  27.48 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  24.55 
 
 
424 aa  73.2  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  27.67 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  27.55 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  25.06 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  28.41 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  24.65 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  28.43 
 
 
447 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6266  hypothetical protein  26.9 
 
 
354 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  28.95 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  28.44 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  27.8 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  24.57 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  27.44 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  27.19 
 
 
432 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  28.21 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  28.21 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  27.08 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  26.79 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  24.77 
 
 
420 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  25.65 
 
 
429 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0524  hypothetical protein  31.13 
 
 
388 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000260703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  29.57 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1171  hypothetical protein  21.96 
 
 
450 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  23.58 
 
 
420 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  28.14 
 
 
455 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  28.14 
 
 
447 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  28.14 
 
 
455 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  28.14 
 
 
463 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  28.14 
 
 
455 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  26.3 
 
 
390 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  31.76 
 
 
457 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  23.58 
 
 
420 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  23.58 
 
 
420 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  28.14 
 
 
455 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  24.54 
 
 
420 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  24.54 
 
 
420 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3476  hypothetical protein  26.12 
 
 
441 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380975  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2035  type III effector Hrp-dependent outers  28.03 
 
 
449 aa  63.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0275418  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  28.23 
 
 
437 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  23.58 
 
 
420 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>