142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0194 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  99.76 
 
 
423 aa  850    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  99.05 
 
 
423 aa  844    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  100 
 
 
423 aa  853    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  99.76 
 
 
423 aa  850    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  43.3 
 
 
422 aa  319  6e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  44.66 
 
 
428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3536  type III effector Hrp-dependent outers  42.19 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  42.76 
 
 
439 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  33.18 
 
 
427 aa  190  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  32.31 
 
 
381 aa  161  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  32.2 
 
 
455 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  32.11 
 
 
430 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  31.52 
 
 
440 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  33.25 
 
 
399 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  28.05 
 
 
572 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  27.82 
 
 
572 aa  133  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  28.38 
 
 
572 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  27.78 
 
 
427 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3263  type III effector Hrp-dependent outers  31.52 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.197433  normal  0.0349209 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  28.18 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  29.25 
 
 
422 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  34.34 
 
 
262 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  29.23 
 
 
425 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3566  hypothetical protein  31.26 
 
 
409 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00898441  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  26.44 
 
 
417 aa  123  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  29 
 
 
425 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  29 
 
 
425 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  30.47 
 
 
432 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  29.74 
 
 
437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  31.12 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  28.94 
 
 
423 aa  116  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  27.91 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  27.66 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2336  hypothetical protein  31.35 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8221  type III effector Hrp-dependent outers  27.96 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0564  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  29.84 
 
 
770 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.432239 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  28.21 
 
 
422 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  29.89 
 
 
422 aa  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  26.23 
 
 
418 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  27.17 
 
 
424 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  28.14 
 
 
423 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  28.31 
 
 
425 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  28.41 
 
 
420 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  30 
 
 
424 aa  108  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  27.17 
 
 
424 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  28.18 
 
 
420 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  28.18 
 
 
420 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  28.18 
 
 
420 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  28.18 
 
 
420 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  28.24 
 
 
426 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  28.74 
 
 
425 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  24.53 
 
 
413 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  27.98 
 
 
420 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  27.98 
 
 
420 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  27.73 
 
 
423 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  28.31 
 
 
420 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  27.75 
 
 
420 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  28.86 
 
 
426 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  27.86 
 
 
428 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  25.69 
 
 
432 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2989  hypothetical protein  44.81 
 
 
390 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.832553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  27.08 
 
 
429 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  28.77 
 
 
426 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5836  hypothetical protein  27.75 
 
 
419 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.244996  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  26.76 
 
 
424 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  27.11 
 
 
433 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  27.93 
 
 
439 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  27.87 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  27.56 
 
 
447 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  25.75 
 
 
427 aa  97.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5258  type III effector Hrp-dependent outer  26.26 
 
 
469 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69157  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  26.98 
 
 
424 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  26.88 
 
 
433 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  26.88 
 
 
433 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  26.42 
 
 
432 aa  96.3  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  27.17 
 
 
424 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  26.67 
 
 
426 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  26.81 
 
 
427 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  27.07 
 
 
455 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  27.07 
 
 
455 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  27.07 
 
 
455 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  27.91 
 
 
390 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  27.13 
 
 
420 aa  94.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  28.04 
 
 
388 aa  94  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  27.54 
 
 
463 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  27.51 
 
 
455 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  31.71 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  26.24 
 
 
433 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  27.93 
 
 
436 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  27.75 
 
 
416 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  25.71 
 
 
432 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  28.22 
 
 
447 aa  87.4  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0524  hypothetical protein  24.22 
 
 
388 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000260703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  24.03 
 
 
463 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  26.33 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  26.97 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  32.87 
 
 
511 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  25.44 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  26.05 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  26.81 
 
 
437 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>