75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8221 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8221  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 399 aa  775    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  30.82 
 
 		 427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  32.08 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  28.4 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  28.17 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  28.17 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  27.96 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  31.53 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  28.94 
 
 		 430 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  31.21 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  27.69 
 
 		 439 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  31.13 
 
 		 410 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3536  type III effector Hrp-dependent outers  27.79 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  28.77 
 
 		 422 aa  97.1  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  28.44 
 
 		 427 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5836  hypothetical protein  30.05 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.244996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6266  hypothetical protein  29.62 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  27.45 
 
 		 425 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  27.45 
 
 		 425 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3566  hypothetical protein  29.34 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00898441  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  27.63 
 
 		 425 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8126  type III effector Hrp-dependent outers  32.13 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302902  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3980  hypothetical protein  27.59 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0564  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  28.77 
 
 		 770 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.432239 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1143  hypothetical protein  31.3 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1035  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  29.05 
 
 		 792 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  29.98 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  28.85 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1102  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  29.89 
 
 		 788 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0524  hypothetical protein  32.84 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000260703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  27.83 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2989  hypothetical protein  30.3 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.832553  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1158  hypothetical protein  31.06 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1466  type III effector Hrp-dependent outers  29.38 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  28.51 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  35.42 
 
 		 262 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3263  type III effector Hrp-dependent outers  30.02 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.197433  normal  0.0349209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  23.34 
 
 		 572 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6443  hypothetical protein  28.21 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235172 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  22.33 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  23.43 
 
 		 572 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  24.22 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2151  hypothetical protein  29.02 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3049  hypothetical protein  39.84 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0679578 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  27.46 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  23.61 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4643  hypothetical protein  29 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0336698  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3404  hypothetical protein  39.02 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  23.76 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0918  hypothetical protein  22.9 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  29.03 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  29.74 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  23.33 
 
 		 424 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  25.06 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  25.39 
 
 		 426 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  20.88 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  28.67 
 
 		 425 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  25.33 
 
 		 425 aa  49.7  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4366  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  27.47 
 
 		 721 aa  49.7  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2336  hypothetical protein  36.49 
 
 		 448 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  27.82 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  25.17 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  25.17 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  29.31 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  28.02 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  24.94 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  24.94 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  27.8 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  28.77 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  33.33 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  28.1 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  31.78 
 
 		 466 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0188  hypothetical protein  24.02 
 
 		 448 aa  43.5  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.46953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  24.36 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  23.43 
 
 		 434 aa  43.1  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>