122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2151 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2151  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  691    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0524  hypothetical protein  33.94 
 
 		 388 aa  202  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000260703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  33.16 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  37.75 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  37.09 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  37.09 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  37.09 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  34.23 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  32.89 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3566  hypothetical protein  35.15 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00898441  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  22.44 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  33.03 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  35.26 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  35.06 
 
 		 422 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  32.1 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5836  hypothetical protein  38.64 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.244996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  23.06 
 
 		 425 aa  69.3  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2989  hypothetical protein  35.71 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.832553  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  32.91 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  30.06 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3263  type III effector Hrp-dependent outers  36.42 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.197433  normal  0.0349209 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  35.44 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3980  hypothetical protein  30.33 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  36.96 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  36.08 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  36.08 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8221  type III effector Hrp-dependent outers  29.02 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  36.13 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  29.33 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  29.24 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  31.87 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  35.53 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  34.62 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  33.55 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  29.56 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  37.96 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0564  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  29.5 
 
 		 770 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.432239 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  31.45 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  32.97 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  24.59 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  29.45 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  29.01 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  29.38 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  26.14 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  30.81 
 
 		 511 aa  59.3  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3536  type III effector Hrp-dependent outers  35.76 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2502  hypothetical protein  31.29 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109419  hitchhiker  0.000366743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  31.9 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  28.4 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  32.28 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  32.28 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  26.72 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1035  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  36.17 
 
 		 792 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  29.05 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  23.92 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  28.4 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  28.4 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  28.4 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  28.4 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  29.19 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  28.97 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4366  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  37.88 
 
 		 721 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  29.05 
 
 		 420 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  29.94 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  29.05 
 
 		 420 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  26.23 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  28.49 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  29.05 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  28.49 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  26.95 
 
 		 439 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  29.88 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  26.08 
 
 		 432 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  30.12 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  30.57 
 
 		 426 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1689  hypothetical protein  28.46 
 
 		 449 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1991  type III effector Hrp-dependent outers  31.72 
 
 		 440 aa  52.8  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.28954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  30.18 
 
 		 434 aa  52.8  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2336  hypothetical protein  31.58 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  30.97 
 
 		 425 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  29.56 
 
 		 572 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  25.13 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  31.25 
 
 		 423 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  29.75 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  29.3 
 
 		 466 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6266  hypothetical protein  27.86 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  30.97 
 
 		 426 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  27.1 
 
 		 424 aa  50.4  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  27.27 
 
 		 424 aa  50.4  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  29.63 
 
 		 422 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  29.59 
 
 		 434 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  29.59 
 
 		 434 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  31.17 
 
 		 422 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  25 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  25.77 
 
 		 455 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  25.77 
 
 		 455 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  31.87 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  25.77 
 
 		 455 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  31.17 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  27.95 
 
 		 433 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  24.1 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>