37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1689 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_18061  hypothetical protein  86.8 
 
 
449 aa  791    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17891  hypothetical protein  85.23 
 
 
449 aa  780    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1689  hypothetical protein  100 
 
 
449 aa  902    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17841  hypothetical protein  70.25 
 
 
450 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17181  hypothetical protein  42.89 
 
 
457 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0804428  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  38.12 
 
 
448 aa  342  7e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1171  hypothetical protein  42.54 
 
 
450 aa  335  9e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25801  hypothetical protein  39.48 
 
 
480 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0188  hypothetical protein  38.34 
 
 
448 aa  334  2e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.46953  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20461  hypothetical protein  42.13 
 
 
450 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3021  type III effector Hrp-dependent outers  35.56 
 
 
438 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2739  type III effector Hrp-dependent outers  34.7 
 
 
439 aa  279  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.176872  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2604  type III effector Hrp-dependent outers  35.62 
 
 
439 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3476  hypothetical protein  35.53 
 
 
441 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380975  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2035  type III effector Hrp-dependent outers  34.22 
 
 
449 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0275418  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3502  type III effector Hrp-dependent outers  34.96 
 
 
439 aa  275  9e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780183  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1991  type III effector Hrp-dependent outers  35.16 
 
 
440 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.28954  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  35.32 
 
 
441 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2502  hypothetical protein  38.77 
 
 
437 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109419  hitchhiker  0.000366743 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0048  hypothetical protein  34.15 
 
 
444 aa  252  9.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1363  hypothetical protein  33.41 
 
 
445 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301719  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1666  hypothetical protein  33.18 
 
 
445 aa  250  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.483704  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00873  conserved hypothetical protein  29.72 
 
 
488 aa  193  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.410589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00600  hypothetical protein  26.75 
 
 
455 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0504  hypothetical protein  27.18 
 
 
491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.257323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0272  hypothetical protein  26.46 
 
 
502 aa  152  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  25.62 
 
 
457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0654  hypothetical protein  23.15 
 
 
411 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603947  normal  0.367778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  21.37 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  21.1 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  21.37 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  19.67 
 
 
430 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  19.78 
 
 
399 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  26.55 
 
 
262 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  22.34 
 
 
427 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  19.77 
 
 
455 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2151  hypothetical protein  38.89 
 
 
356 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>