44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_17841 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_17841  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  896    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17891  hypothetical protein  69.13 
 
 
449 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18061  hypothetical protein  69.35 
 
 
449 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1689  hypothetical protein  70.25 
 
 
449 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1171  hypothetical protein  43.21 
 
 
450 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  38.34 
 
 
448 aa  361  2e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17181  hypothetical protein  42.09 
 
 
457 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0804428  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20461  hypothetical protein  43.21 
 
 
450 aa  358  7e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25801  hypothetical protein  38.82 
 
 
480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0188  hypothetical protein  38.53 
 
 
448 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.46953  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2604  type III effector Hrp-dependent outers  37.61 
 
 
439 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3502  type III effector Hrp-dependent outers  37.17 
 
 
439 aa  289  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780183  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3021  type III effector Hrp-dependent outers  38.14 
 
 
438 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2035  type III effector Hrp-dependent outers  34.22 
 
 
449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0275418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2739  type III effector Hrp-dependent outers  35.54 
 
 
439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.176872  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1991  type III effector Hrp-dependent outers  36.87 
 
 
440 aa  282  7.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.28954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3476  hypothetical protein  35.33 
 
 
441 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380975  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  37.72 
 
 
441 aa  276  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2502  hypothetical protein  37.86 
 
 
437 aa  266  5.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109419  hitchhiker  0.000366743 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1666  hypothetical protein  35.16 
 
 
445 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.483704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1363  hypothetical protein  35.16 
 
 
445 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301719  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0048  hypothetical protein  33.48 
 
 
444 aa  254  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00873  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 
488 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.410589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00600  hypothetical protein  27.83 
 
 
455 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0504  hypothetical protein  27.27 
 
 
491 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.257323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0272  hypothetical protein  27.03 
 
 
502 aa  156  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  26.17 
 
 
457 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0654  hypothetical protein  23.53 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603947  normal  0.367778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  20.84 
 
 
399 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  20.72 
 
 
422 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  22.51 
 
 
430 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  20.86 
 
 
455 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  21.23 
 
 
427 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  25.99 
 
 
262 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  21.79 
 
 
425 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  21.43 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  21.43 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  18.48 
 
 
381 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  19.57 
 
 
440 aa  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  19.84 
 
 
427 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  21.31 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  22.27 
 
 
572 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  21.4 
 
 
572 aa  44.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  22.56 
 
 
409 aa  44.3  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>