45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0158 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  875    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0188  hypothetical protein  72.04 
 
 
448 aa  597  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.46953  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25801  hypothetical protein  64.33 
 
 
480 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17181  hypothetical protein  47.32 
 
 
457 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0804428  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1171  hypothetical protein  45.01 
 
 
450 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20461  hypothetical protein  44.77 
 
 
450 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17841  hypothetical protein  38.34 
 
 
450 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18061  hypothetical protein  38.08 
 
 
449 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17891  hypothetical protein  38.31 
 
 
449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1689  hypothetical protein  38.12 
 
 
449 aa  328  9e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3021  type III effector Hrp-dependent outers  40.58 
 
 
438 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2739  type III effector Hrp-dependent outers  42.14 
 
 
439 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.176872  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3502  type III effector Hrp-dependent outers  41.23 
 
 
439 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780183  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2604  type III effector Hrp-dependent outers  40.79 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3476  hypothetical protein  41.69 
 
 
441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380975  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1991  type III effector Hrp-dependent outers  41.28 
 
 
440 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.28954  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2035  type III effector Hrp-dependent outers  42.83 
 
 
449 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0275418  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  40.35 
 
 
441 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1666  hypothetical protein  42.73 
 
 
445 aa  286  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.483704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1363  hypothetical protein  42.73 
 
 
445 aa  286  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301719  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0048  hypothetical protein  40.89 
 
 
444 aa  271  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2502  hypothetical protein  40.22 
 
 
437 aa  256  5e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109419  hitchhiker  0.000366743 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00873  conserved hypothetical protein  31.84 
 
 
488 aa  183  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.410589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0504  hypothetical protein  31.13 
 
 
491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.257323 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00600  hypothetical protein  32.98 
 
 
455 aa  170  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  35.62 
 
 
457 aa  160  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0272  hypothetical protein  30.48 
 
 
502 aa  156  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0654  hypothetical protein  32.02 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603947  normal  0.367778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  29.42 
 
 
399 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  27.08 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  27.08 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  27.46 
 
 
425 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  26.89 
 
 
427 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  25.12 
 
 
430 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0564  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  27 
 
 
770 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.432239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2989  hypothetical protein  42.68 
 
 
390 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.832553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  24.14 
 
 
262 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  29.58 
 
 
455 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  26.43 
 
 
422 aa  47  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  27.44 
 
 
440 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  28.67 
 
 
432 aa  46.6  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  26.79 
 
 
381 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  25.87 
 
 
428 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  27.58 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  28.27 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>