34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0048 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0048  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  877    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2035  type III effector Hrp-dependent outers  64.83 
 
 		 449 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0275418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2739  type III effector Hrp-dependent outers  62.07 
 
 		 439 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.176872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3476  hypothetical protein  59.59 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380975  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1991  type III effector Hrp-dependent outers  59.54 
 
 		 440 aa  494  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.28954  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3021  type III effector Hrp-dependent outers  57.7 
 
 		 438 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1363  hypothetical protein  62.3 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1666  hypothetical protein  62.07 
 
 		 445 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.483704  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  55.5 
 
 		 441 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2604  type III effector Hrp-dependent outers  55.73 
 
 		 439 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3502  type III effector Hrp-dependent outers  55.5 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780183  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25801  hypothetical protein  43.07 
 
 		 480 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17181  hypothetical protein  40 
 
 		 457 aa  310  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0804428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20461  hypothetical protein  37.33 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1171  hypothetical protein  36.73 
 
 		 450 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  41.11 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2502  hypothetical protein  41.24 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109419  hitchhiker  0.000366743 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0188  hypothetical protein  39.21 
 
 		 448 aa  266  7e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.46953  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17841  hypothetical protein  33.05 
 
 		 450 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17891  hypothetical protein  33.63 
 
 		 449 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1689  hypothetical protein  33.7 
 
 		 449 aa  256  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18061  hypothetical protein  32.08 
 
 		 449 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00873  conserved hypothetical protein  32.96 
 
 		 488 aa  222  8e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0504  hypothetical protein  36.72 
 
 		 491 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.257323 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00600  hypothetical protein  37.3 
 
 		 455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0272  hypothetical protein  35.38 
 
 		 502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  38.6 
 
 		 457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0654  hypothetical protein  36.36 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603947  normal  0.367778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  31.13 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  31.63 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  31.4 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  26.42 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  32.02 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  28.26 
 
 		 427 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>