39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_18061 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_17891  hypothetical protein  95.77 
 
 
449 aa  867    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1689  hypothetical protein  86.8 
 
 
449 aa  771    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18061  hypothetical protein  100 
 
 
449 aa  901    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17841  hypothetical protein  69.35 
 
 
450 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17181  hypothetical protein  42.67 
 
 
457 aa  350  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0804428  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  38.08 
 
 
448 aa  340  2e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25801  hypothetical protein  39.57 
 
 
480 aa  340  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0188  hypothetical protein  38.98 
 
 
448 aa  333  3e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.46953  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1171  hypothetical protein  42.32 
 
 
450 aa  328  9e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20461  hypothetical protein  41.91 
 
 
450 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3021  type III effector Hrp-dependent outers  37.11 
 
 
438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3476  hypothetical protein  36 
 
 
441 aa  276  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380975  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2604  type III effector Hrp-dependent outers  36.67 
 
 
439 aa  275  9e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3502  type III effector Hrp-dependent outers  36.22 
 
 
439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780183  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  38.38 
 
 
441 aa  272  9e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2035  type III effector Hrp-dependent outers  34.37 
 
 
449 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0275418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2739  type III effector Hrp-dependent outers  34.51 
 
 
439 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.176872  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1991  type III effector Hrp-dependent outers  34.73 
 
 
440 aa  264  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.28954  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2502  hypothetical protein  37.36 
 
 
437 aa  259  9e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109419  hitchhiker  0.000366743 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0048  hypothetical protein  32.44 
 
 
444 aa  243  6e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1363  hypothetical protein  33.85 
 
 
445 aa  243  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301719  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1666  hypothetical protein  33.63 
 
 
445 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.483704  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00873  conserved hypothetical protein  30.11 
 
 
488 aa  190  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.410589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0504  hypothetical protein  27.81 
 
 
491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.257323 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00600  hypothetical protein  26.71 
 
 
455 aa  159  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0272  hypothetical protein  27.29 
 
 
502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  26.06 
 
 
457 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0654  hypothetical protein  29.63 
 
 
411 aa  87  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603947  normal  0.367778 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  20.88 
 
 
430 aa  61.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  22.83 
 
 
425 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  22.83 
 
 
425 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  25.33 
 
 
262 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  23.1 
 
 
425 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  21.47 
 
 
455 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  18.59 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0524  hypothetical protein  27.22 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000260703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  20.86 
 
 
440 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  22.73 
 
 
572 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  22.73 
 
 
572 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>