48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3021 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1991  type III effector Hrp-dependent outers  73.74 
 
 
440 aa  665    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.28954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3476  hypothetical protein  73.35 
 
 
441 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380975  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3502  type III effector Hrp-dependent outers  79.36 
 
 
439 aa  713    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780183  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2739  type III effector Hrp-dependent outers  73.29 
 
 
439 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.176872  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3021  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 
438 aa  896    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2604  type III effector Hrp-dependent outers  80.73 
 
 
439 aa  725    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  69.79 
 
 
441 aa  632  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2035  type III effector Hrp-dependent outers  61.7 
 
 
449 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0275418  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1666  hypothetical protein  56.82 
 
 
445 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.483704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1363  hypothetical protein  56.59 
 
 
445 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301719  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0048  hypothetical protein  57.7 
 
 
444 aa  471  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25801  hypothetical protein  44.32 
 
 
480 aa  345  8e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1171  hypothetical protein  39.96 
 
 
450 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20461  hypothetical protein  40.18 
 
 
450 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17181  hypothetical protein  40.35 
 
 
457 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0804428  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  40.58 
 
 
448 aa  310  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2502  hypothetical protein  42.92 
 
 
437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109419  hitchhiker  0.000366743 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0188  hypothetical protein  39.25 
 
 
448 aa  300  5e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.46953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17891  hypothetical protein  37.78 
 
 
449 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18061  hypothetical protein  37.11 
 
 
449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17841  hypothetical protein  38.13 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1689  hypothetical protein  35.6 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00873  conserved hypothetical protein  34.32 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.410589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0504  hypothetical protein  35.06 
 
 
491 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.257323 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00600  hypothetical protein  34.46 
 
 
455 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  35.94 
 
 
457 aa  209  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0272  hypothetical protein  33.26 
 
 
502 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0654  hypothetical protein  30.7 
 
 
411 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603947  normal  0.367778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  27.31 
 
 
399 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  25.56 
 
 
424 aa  63.2  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  25.56 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  34.88 
 
 
262 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  23.61 
 
 
422 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  24.08 
 
 
427 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  23.47 
 
 
430 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  24.34 
 
 
428 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  23.68 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  24.94 
 
 
427 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  24.58 
 
 
440 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  23.88 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  23.25 
 
 
572 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  27.81 
 
 
455 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  22.05 
 
 
417 aa  47  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0524  hypothetical protein  29.14 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000260703 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  23.21 
 
 
425 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  23.21 
 
 
425 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  28.71 
 
 
381 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2336  hypothetical protein  29.93 
 
 
448 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>