41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2035 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2035  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 449 aa  907    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0275418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2739  type III effector Hrp-dependent outers  68.12 
 
 		 439 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.176872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1991  type III effector Hrp-dependent outers  65.37 
 
 		 440 aa  578  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.28954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3476  hypothetical protein  64.91 
 
 		 441 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380975  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3021  type III effector Hrp-dependent outers  61.7 
 
 		 438 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  60.18 
 
 		 441 aa  555  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1666  hypothetical protein  65.83 
 
 		 445 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.483704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1363  hypothetical protein  65.83 
 
 		 445 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3502  type III effector Hrp-dependent outers  59.31 
 
 		 439 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780183  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2604  type III effector Hrp-dependent outers  58.62 
 
 		 439 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0048  hypothetical protein  64.98 
 
 		 444 aa  514  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25801  hypothetical protein  45.13 
 
 		 480 aa  318  9e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20461  hypothetical protein  37.5 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1171  hypothetical protein  37.28 
 
 		 450 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  42.83 
 
 		 448 aa  296  4e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17181  hypothetical protein  37.89 
 
 		 457 aa  293  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0804428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2502  hypothetical protein  44.04 
 
 		 437 aa  292  8e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109419  hitchhiker  0.000366743 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0188  hypothetical protein  40.62 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.46953  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17841  hypothetical protein  33.62 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18061  hypothetical protein  34.37 
 
 		 449 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1689  hypothetical protein  33.77 
 
 		 449 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17891  hypothetical protein  33.92 
 
 		 449 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00873  conserved hypothetical protein  34.91 
 
 		 488 aa  259  6e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0504  hypothetical protein  36.27 
 
 		 491 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.257323 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00600  hypothetical protein  36.22 
 
 		 455 aa  206  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0272  hypothetical protein  35.88 
 
 		 502 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  38.01 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0654  hypothetical protein  35.03 
 
 		 411 aa  129  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603947  normal  0.367778 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  27.09 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  28.38 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  28.03 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  28.03 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  25.94 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  27.92 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  28.62 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  27.02 
 
 		 440 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  30.43 
 
 		 422 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  26.28 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  25.06 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  27.91 
 
 		 262 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  25.16 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>