40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_20461 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1171  hypothetical protein  98.22 
 
 
450 aa  903    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20461  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  915    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17181  hypothetical protein  52.01 
 
 
457 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0804428  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25801  hypothetical protein  47.38 
 
 
480 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  44.77 
 
 
448 aa  418  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0188  hypothetical protein  44.32 
 
 
448 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.46953  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17841  hypothetical protein  43.21 
 
 
450 aa  350  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17891  hypothetical protein  43.24 
 
 
449 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2739  type III effector Hrp-dependent outers  40.22 
 
 
439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.176872  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18061  hypothetical protein  41.91 
 
 
449 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1689  hypothetical protein  42.13 
 
 
449 aa  319  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2604  type III effector Hrp-dependent outers  39.91 
 
 
439 aa  319  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3476  hypothetical protein  40.62 
 
 
441 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380975  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3502  type III effector Hrp-dependent outers  39.69 
 
 
439 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780183  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3021  type III effector Hrp-dependent outers  40.18 
 
 
438 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1991  type III effector Hrp-dependent outers  41.56 
 
 
440 aa  310  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.28954  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2035  type III effector Hrp-dependent outers  37.5 
 
 
449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0275418  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1666  hypothetical protein  38.17 
 
 
445 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.483704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1363  hypothetical protein  38.17 
 
 
445 aa  302  9e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301719  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0048  hypothetical protein  36.95 
 
 
444 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  39.96 
 
 
441 aa  292  8e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2502  hypothetical protein  33.7 
 
 
437 aa  242  7.999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109419  hitchhiker  0.000366743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00600  hypothetical protein  29.41 
 
 
455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0504  hypothetical protein  29.91 
 
 
491 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.257323 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00873  conserved hypothetical protein  28.6 
 
 
488 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.410589 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0272  hypothetical protein  27.71 
 
 
502 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  28.04 
 
 
457 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0654  hypothetical protein  34.97 
 
 
411 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603947  normal  0.367778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  21.93 
 
 
399 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  22.82 
 
 
425 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  22.71 
 
 
425 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  22.71 
 
 
425 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  22.31 
 
 
427 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  22.62 
 
 
455 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  26.41 
 
 
262 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  24.08 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  24.08 
 
 
424 aa  47.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  22.06 
 
 
428 aa  47.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  20.47 
 
 
422 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  20.04 
 
 
416 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>