116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2454 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 440 aa  835    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  57.88 
 
 		 455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2336  hypothetical protein  53.39 
 
 		 448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3263  type III effector Hrp-dependent outers  44.42 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.197433  normal  0.0349209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  31.6 
 
 		 423 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  31.6 
 
 		 423 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  31.83 
 
 		 423 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  31.6 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  33.33 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  34.2 
 
 		 262 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  29.16 
 
 		 572 aa  130  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  29.41 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  30.13 
 
 		 422 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  29.66 
 
 		 430 aa  123  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  29.13 
 
 		 572 aa  123  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  35.35 
 
 		 399 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  29.32 
 
 		 439 aa  113  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3536  type III effector Hrp-dependent outers  28.35 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  28.38 
 
 		 572 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  33.33 
 
 		 425 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  33.33 
 
 		 425 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  30.54 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  33.03 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  30.82 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2989  hypothetical protein  45.86 
 
 		 390 aa  93.2  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.832553  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8221  type III effector Hrp-dependent outers  29.58 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3566  hypothetical protein  28.44 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00898441  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  24.26 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  23.53 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0504  hypothetical protein  26.92 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.257323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2035  type III effector Hrp-dependent outers  27.27 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0275418  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0918  hypothetical protein  24.52 
 
 		 355 aa  69.7  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0564  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  27.44 
 
 		 770 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.432239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  31.13 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  29.56 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  31.14 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  25.39 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1466  type III effector Hrp-dependent outers  28.6 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0524  hypothetical protein  23.7 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000260703 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8126  type III effector Hrp-dependent outers  29.06 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302902  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  30.36 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5836  hypothetical protein  27.16 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.244996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4643  hypothetical protein  30.83 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0336698  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  29.1 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  22.74 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0272  hypothetical protein  26.03 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17841  hypothetical protein  19.36 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  27.96 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18061  hypothetical protein  21.39 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3021  type III effector Hrp-dependent outers  23.99 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  28.17 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  28.38 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  26.43 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  26.43 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  27.38 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  26.27 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  26.33 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  26.27 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  30.95 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  27.97 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1143  hypothetical protein  28.16 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0654  hypothetical protein  37.43 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603947  normal  0.367778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  24.4 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  24.15 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6266  hypothetical protein  29.87 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  24.26 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  24.15 
 
 		 434 aa  53.9  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  24.26 
 
 		 420 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  24.26 
 
 		 420 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  31.7 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  26.09 
 
 		 455 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  27.24 
 
 		 420 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2739  type III effector Hrp-dependent outers  25.88 
 
 		 439 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.176872  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  27.57 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1171  hypothetical protein  23.22 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  24.26 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  24.01 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  26.88 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0048  hypothetical protein  32.02 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  28.04 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  28.04 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2151  hypothetical protein  35.29 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  27.57 
 
 		 390 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  27.17 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3476  hypothetical protein  23.75 
 
 		 441 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380975  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  28.18 
 
 		 424 aa  49.7  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  24.49 
 
 		 428 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  26 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1363  hypothetical protein  27.76 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  25.23 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4366  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  32.23 
 
 		 721 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  29.28 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6443  hypothetical protein  36.57 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235172 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1991  type III effector Hrp-dependent outers  24.92 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.28954  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0188  hypothetical protein  24.8 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.46953  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2502  hypothetical protein  26.39 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109419  hitchhiker  0.000366743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  29.09 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  24.85 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1035  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  26.4 
 
 		 792 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20461  hypothetical protein  22.69 
 
 		 450 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>