56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1466 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1466  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 366 aa  702    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8126  type III effector Hrp-dependent outers  89.4 
 
 		 368 aa  628  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4643  hypothetical protein  66.4 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0336698  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1158  hypothetical protein  48.86 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1143  hypothetical protein  41.03 
 
 		 374 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  36.29 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0564  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  32.93 
 
 		 770 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.432239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3566  hypothetical protein  32.58 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00898441  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  30.79 
 
 		 427 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  31.95 
 
 		 425 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  31.95 
 
 		 425 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  33.09 
 
 		 425 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  30.33 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  27.71 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  28.47 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3049  hypothetical protein  34.43 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0679578 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5836  hypothetical protein  29.57 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.244996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  32.54 
 
 		 416 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3404  hypothetical protein  33.88 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  29.5 
 
 		 432 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6266  hypothetical protein  29.61 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3980  hypothetical protein  30 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8221  type III effector Hrp-dependent outers  29.12 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  31.31 
 
 		 410 aa  67  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  27.31 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4366  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  28.17 
 
 		 721 aa  63.2  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6443  hypothetical protein  29.43 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2989  hypothetical protein  39.5 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.832553  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  28.67 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  26 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  26 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  26 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  27.97 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  26.42 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  26.27 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  26.67 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  21.46 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0918  hypothetical protein  23.5 
 
 		 355 aa  53.1  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  29.98 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  27.86 
 
 		 427 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1035  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  28.12 
 
 		 792 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3536  type III effector Hrp-dependent outers  25.11 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  27.71 
 
 		 425 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  26.2 
 
 		 424 aa  46.6  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  40.18 
 
 		 429 aa  46.2  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  24.88 
 
 		 439 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  28.17 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  27.74 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  26.2 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  25.59 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  25.83 
 
 		 420 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  29.55 
 
 		 422 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  25.83 
 
 		 420 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  25.83 
 
 		 420 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  27.78 
 
 		 437 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  29.56 
 
 		 423 aa  42.7  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>