42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4643 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4643  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  702    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0336698  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1466  type III effector Hrp-dependent outers  66.4 
 
 		 366 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8126  type III effector Hrp-dependent outers  64.15 
 
 		 368 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302902  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1158  hypothetical protein  48.6 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1143  hypothetical protein  40.05 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3049  hypothetical protein  35.1 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0679578 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  30.97 
 
 		 427 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  27.93 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3404  hypothetical protein  33.98 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  33.1 
 
 		 425 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  30.81 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3566  hypothetical protein  32.84 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00898441  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  32.86 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  32.86 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  32.13 
 
 		 399 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3980  hypothetical protein  30.46 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  30.34 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6266  hypothetical protein  33.52 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0564  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  32.08 
 
 		 770 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.432239 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5836  hypothetical protein  30.37 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.244996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6443  hypothetical protein  32.7 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  29.26 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  21.93 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2989  hypothetical protein  31.47 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.832553  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0918  hypothetical protein  24.6 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8221  type III effector Hrp-dependent outers  29.55 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  26.37 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  26.37 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  26.6 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  26.37 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  30.94 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  26.37 
 
 		 423 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  28.98 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  30.97 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2336  hypothetical protein  27.34 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  28.07 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  28.14 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4366  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  29.08 
 
 		 721 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  29.67 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0524  hypothetical protein  22.6 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000260703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  27.74 
 
 		 427 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  35 
 
 		 422 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>