65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8126 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8126  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 368 aa  709    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1466  type III effector Hrp-dependent outers  89.4 
 
 		 366 aa  614  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4643  hypothetical protein  64.15 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0336698  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1158  hypothetical protein  49.71 
 
 		 382 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1143  hypothetical protein  41.3 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  35.94 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3566  hypothetical protein  31.9 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00898441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  27.94 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0564  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  33.18 
 
 		 770 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.432239 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  30.47 
 
 		 427 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  31.46 
 
 		 425 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  31.46 
 
 		 425 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  29.9 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  29.32 
 
 		 381 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  32.28 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  32.91 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5836  hypothetical protein  29.07 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.244996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3049  hypothetical protein  34.51 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0679578 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8221  type III effector Hrp-dependent outers  31.88 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  28.91 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6266  hypothetical protein  30.58 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3404  hypothetical protein  34.24 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3980  hypothetical protein  29.16 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  31.82 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2989  hypothetical protein  33.16 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.832553  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6443  hypothetical protein  32.45 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235172 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  26.92 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  26.92 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  26.92 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  27.79 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  27.12 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  28.1 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  28.61 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4366  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  27.59 
 
 		 721 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  29.4 
 
 		 422 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  27.56 
 
 		 423 aa  53.1  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  20.83 
 
 		 409 aa  52.8  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3263  type III effector Hrp-dependent outers  29.22 
 
 		 454 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.197433  normal  0.0349209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  26.49 
 
 		 455 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  26.7 
 
 		 429 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  28.01 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1035  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  29.33 
 
 		 792 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  28.37 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0524  hypothetical protein  23.32 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000260703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  27.23 
 
 		 427 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  24.36 
 
 		 439 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  40.18 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  29.13 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0918  hypothetical protein  23.81 
 
 		 355 aa  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  33.82 
 
 		 440 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  25.42 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  30.99 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  27.99 
 
 		 425 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  26.24 
 
 		 432 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  25.42 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3536  type III effector Hrp-dependent outers  25 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  34.78 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  26.06 
 
 		 432 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  28.25 
 
 		 439 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  25.18 
 
 		 420 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  34.74 
 
 		 436 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  25.88 
 
 		 433 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  26.32 
 
 		 447 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  25.18 
 
 		 420 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  32.61 
 
 		 404 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>