38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1158 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1158  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  743    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8126  type III effector Hrp-dependent outers  49.86 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1466  type III effector Hrp-dependent outers  48.62 
 
 		 366 aa  262  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4643  hypothetical protein  48.22 
 
 		 371 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0336698  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1143  hypothetical protein  37.17 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  34.4 
 
 		 416 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  26.15 
 
 		 430 aa  86.3  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3566  hypothetical protein  29.23 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00898441  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6266  hypothetical protein  32.03 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  28.05 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  27.74 
 
 		 422 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3404  hypothetical protein  32.88 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0564  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  30.6 
 
 		 770 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.432239 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  31.93 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  28.47 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8221  type III effector Hrp-dependent outers  31.17 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3049  hypothetical protein  32.88 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0679578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4366  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  30.23 
 
 		 721 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  28.44 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3980  hypothetical protein  27.01 
 
 		 353 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  28.85 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6443  hypothetical protein  29.46 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2989  hypothetical protein  32.64 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.832553  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5836  hypothetical protein  28.82 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.244996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  29.28 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  28.54 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  28.29 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  28.54 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  21.55 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0918  hypothetical protein  24.8 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  29.86 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  26.76 
 
 		 455 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  22.98 
 
 		 423 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  34.94 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  23.11 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  24.6 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  22.74 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  22.74 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>