41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0918 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0918  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  709    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  25.92 
 
 		 455 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  25.07 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  28.57 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  21.5 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3049  hypothetical protein  25.72 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0679578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4366  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  23.96 
 
 		 721 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  29.37 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  31.58 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  24.4 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  22.72 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  22.72 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  22.71 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  23.99 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  22.71 
 
 		 572 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  25.6 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3980  hypothetical protein  29.29 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  25.3 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  25.3 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  21.96 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4643  hypothetical protein  23.53 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0336698  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  19.77 
 
 		 572 aa  54.3  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  24.34 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1158  hypothetical protein  24.18 
 
 		 382 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  32.28 
 
 		 466 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3404  hypothetical protein  24.59 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  23.89 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8221  type III effector Hrp-dependent outers  22.9 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3536  type III effector Hrp-dependent outers  37.23 
 
 		 442 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1466  type III effector Hrp-dependent outers  25 
 
 		 366 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  34.96 
 
 		 439 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  30.72 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  31 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8126  type III effector Hrp-dependent outers  23.81 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2336  hypothetical protein  28.26 
 
 		 448 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3263  type III effector Hrp-dependent outers  25.65 
 
 		 454 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.197433  normal  0.0349209 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1143  hypothetical protein  25.14 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2989  hypothetical protein  29.73 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.832553  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  26.56 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  28.81 
 
 		 432 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0524  hypothetical protein  33.71 
 
 		 388 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000260703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>