131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3106 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  79.67 
 
 
420 aa  684    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  79.67 
 
 
420 aa  685    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  79.67 
 
 
420 aa  686    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  79.67 
 
 
420 aa  685    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  99.29 
 
 
420 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  100 
 
 
420 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  99.76 
 
 
420 aa  861    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  99.52 
 
 
420 aa  859    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  99.76 
 
 
420 aa  861    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  79.49 
 
 
390 aa  636    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  79.17 
 
 
388 aa  622  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  67.07 
 
 
420 aa  557  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  63.03 
 
 
424 aa  541  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  62.32 
 
 
424 aa  533  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  59.19 
 
 
418 aa  504  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  55.74 
 
 
417 aa  485  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  58.47 
 
 
424 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  58.47 
 
 
424 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  52.78 
 
 
413 aa  442  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  45.41 
 
 
425 aa  363  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  48.57 
 
 
422 aa  361  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  44.68 
 
 
432 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  46.63 
 
 
422 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  44.94 
 
 
436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  47.51 
 
 
423 aa  342  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  45.52 
 
 
433 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  45.52 
 
 
433 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  45.52 
 
 
433 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  45 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  44.58 
 
 
432 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  43.61 
 
 
447 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  45.28 
 
 
433 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  45.11 
 
 
432 aa  332  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  43.47 
 
 
429 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  46.64 
 
 
434 aa  331  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  44.71 
 
 
436 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  43.19 
 
 
439 aa  329  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  43.61 
 
 
447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  46.4 
 
 
434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  46.4 
 
 
434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  45.37 
 
 
427 aa  327  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  42.83 
 
 
455 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  42.83 
 
 
455 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  42.83 
 
 
455 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  42.83 
 
 
455 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  44.1 
 
 
432 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  42.07 
 
 
463 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  44.34 
 
 
437 aa  319  7e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  46.54 
 
 
423 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  43.54 
 
 
437 aa  316  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  45.08 
 
 
423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  45.86 
 
 
427 aa  312  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  42.22 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  42.58 
 
 
422 aa  305  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  42.62 
 
 
437 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  40.28 
 
 
425 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  45.71 
 
 
422 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  43.57 
 
 
419 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  42.28 
 
 
424 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  38.95 
 
 
426 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  39.71 
 
 
426 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  40.67 
 
 
426 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  40.05 
 
 
425 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  40.38 
 
 
426 aa  269  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  40.98 
 
 
416 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  40.17 
 
 
511 aa  255  9e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  38.41 
 
 
466 aa  253  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  41.35 
 
 
424 aa  249  5e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  43.1 
 
 
418 aa  246  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  39.06 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  39.86 
 
 
417 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  30.24 
 
 
419 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  27.21 
 
 
461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  27.39 
 
 
474 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  27.19 
 
 
422 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  26.14 
 
 
469 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  27.94 
 
 
457 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  26.82 
 
 
429 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  28.98 
 
 
458 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  28.16 
 
 
262 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  28.05 
 
 
423 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  28.05 
 
 
423 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  28.05 
 
 
423 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  28.18 
 
 
423 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3121  type III effector Hrp-dependent outers  28.16 
 
 
437 aa  95.9  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  28.51 
 
 
455 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  25.76 
 
 
463 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  28.82 
 
 
439 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  26.42 
 
 
432 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  27.25 
 
 
572 aa  94  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  27.21 
 
 
448 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  27.49 
 
 
469 aa  93.2  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  32.72 
 
 
427 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  25.29 
 
 
430 aa  89.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  27.31 
 
 
449 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  26.67 
 
 
428 aa  88.2  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  25.75 
 
 
448 aa  87  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1068  type III effector Hrp-dependent outer protein  27.42 
 
 
463 aa  86.3  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3536  type III effector Hrp-dependent outers  25.28 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  31.4 
 
 
572 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>