133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5306 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  90.38 
 
 
426 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 
426 aa  832    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  79.16 
 
 
426 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  65.41 
 
 
425 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  66.43 
 
 
422 aa  531  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  66.2 
 
 
437 aa  512  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  67.06 
 
 
426 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  64.94 
 
 
424 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  61.59 
 
 
425 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  62.88 
 
 
396 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  58.59 
 
 
424 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  50.23 
 
 
432 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  49.06 
 
 
422 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  48.82 
 
 
432 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  47.97 
 
 
428 aa  351  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  47.87 
 
 
433 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  47.87 
 
 
433 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  47.87 
 
 
433 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  48.58 
 
 
433 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  43.12 
 
 
425 aa  341  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  48.34 
 
 
432 aa  339  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  46.46 
 
 
429 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  45.29 
 
 
427 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  45.88 
 
 
423 aa  329  6e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  47.59 
 
 
447 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  46.84 
 
 
423 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  44.76 
 
 
436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  46.14 
 
 
439 aa  326  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  46.73 
 
 
455 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  46.73 
 
 
455 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  46.73 
 
 
455 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  46.73 
 
 
455 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  47.61 
 
 
437 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  46.39 
 
 
423 aa  324  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  48 
 
 
437 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  46.45 
 
 
447 aa  323  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  45.9 
 
 
463 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  44.1 
 
 
432 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  46.23 
 
 
422 aa  316  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  43.29 
 
 
424 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  42.82 
 
 
424 aa  310  4e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  40.43 
 
 
417 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  45.18 
 
 
436 aa  310  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  45.24 
 
 
427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  40.9 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  45.32 
 
 
404 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  40.19 
 
 
418 aa  296  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  40.57 
 
 
420 aa  295  8e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  41.78 
 
 
420 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  44.39 
 
 
422 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  41.55 
 
 
420 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  41.55 
 
 
420 aa  290  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  44.63 
 
 
419 aa  289  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  41.55 
 
 
420 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  41.84 
 
 
424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  39.71 
 
 
420 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  39.71 
 
 
420 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  39.71 
 
 
420 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  39.71 
 
 
420 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  42.08 
 
 
424 aa  280  5e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  39.71 
 
 
420 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  41.34 
 
 
434 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  41.34 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  41.67 
 
 
390 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  40.88 
 
 
434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  41.33 
 
 
388 aa  267  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  40.04 
 
 
511 aa  247  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  38.51 
 
 
466 aa  233  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  41.45 
 
 
418 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  40.93 
 
 
416 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  38 
 
 
417 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  29.55 
 
 
419 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  30.96 
 
 
448 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  27.89 
 
 
461 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  31.29 
 
 
432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  29.86 
 
 
444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  28.74 
 
 
449 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  31.81 
 
 
410 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  30.34 
 
 
474 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  30.41 
 
 
429 aa  98.2  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  26.34 
 
 
469 aa  97.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  28.22 
 
 
448 aa  97.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  27.23 
 
 
457 aa  96.3  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7231  type III effector Hrp-dependent outers  28.28 
 
 
448 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0442  hypothetical protein  28.22 
 
 
460 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  30.84 
 
 
458 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  26.67 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  26.67 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  26.67 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  30.33 
 
 
262 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  26.67 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  25.6 
 
 
463 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  27.31 
 
 
427 aa  86.3  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1944  type III effector Hrp-dependent outers  30.28 
 
 
454 aa  86.3  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1068  type III effector Hrp-dependent outer protein  30.99 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  27 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  30.09 
 
 
428 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  29.22 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  26.3 
 
 
469 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  33.19 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>