105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3436 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 455 aa  891    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1733  type III effector Hrp-dependent outers  78.41 
 
 		 452 aa  578  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1068  type III effector Hrp-dependent outer protein  61.17 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  49.33 
 
 		 457 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  49.55 
 
 		 458 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  49.33 
 
 		 474 aa  398  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  44.89 
 
 		 448 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  45.9 
 
 		 448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  45.45 
 
 		 444 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  42.64 
 
 		 461 aa  333  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  41.98 
 
 		 469 aa  332  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  46.43 
 
 		 432 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  47.87 
 
 		 429 aa  322  6e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5258  type III effector Hrp-dependent outer  41.72 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  42.04 
 
 		 469 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  38.63 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3121  type III effector Hrp-dependent outers  35.44 
 
 		 437 aa  276  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1944  type III effector Hrp-dependent outers  39.01 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  37.97 
 
 		 449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7231  type III effector Hrp-dependent outers  36.34 
 
 		 448 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0442  hypothetical protein  36.62 
 
 		 460 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3217  type III effector Hrp-dependent outers  32.51 
 
 		 442 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2027  type III effector Hrp-dependent outers  36.73 
 
 		 428 aa  189  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1449  type III effector Hrp-dependent outers  36.73 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1738  type III effector Hrp-dependent outers  34.51 
 
 		 431 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0119414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  31 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  32.01 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  31.77 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  29.21 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  28.76 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  31.14 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  29.5 
 
 		 427 aa  114  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  33.48 
 
 		 424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  30.32 
 
 		 422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  31.49 
 
 		 428 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  30.6 
 
 		 433 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  30.6 
 
 		 433 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  30.6 
 
 		 433 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  28.57 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  30.29 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  27.09 
 
 		 425 aa  107  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  30.99 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  29.93 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  28.73 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  28.73 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  28.73 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  28.51 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  30.8 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  28.51 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  30.34 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  31.31 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  28.73 
 
 		 420 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  30.25 
 
 		 437 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  30.5 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  30.5 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  30.43 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  30.5 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  30.5 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  29.72 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  29.71 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  28.6 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  30.02 
 
 		 437 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  30.51 
 
 		 422 aa  97.1  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  30.84 
 
 		 425 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  30 
 
 		 463 aa  96.7  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  28.54 
 
 		 404 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  31 
 
 		 426 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  26.24 
 
 		 420 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  27.56 
 
 		 424 aa  94.4  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  24.89 
 
 		 417 aa  94.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  27.56 
 
 		 424 aa  94  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  27.91 
 
 		 432 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  30.82 
 
 		 426 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  29.49 
 
 		 426 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  25.28 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  29.71 
 
 		 422 aa  90.5  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  27.97 
 
 		 420 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  32.35 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  25.73 
 
 		 418 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  27.97 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  25.92 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  27.97 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  26.02 
 
 		 434 aa  87  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  27.09 
 
 		 425 aa  86.7  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  27.53 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  25.92 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  31.05 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  27.46 
 
 		 511 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  30.15 
 
 		 437 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  28.37 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  27.62 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  28.18 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  31.02 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  31.19 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  31.68 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  25.62 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  24.91 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  26.1 
 
 		 422 aa  53.9  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  24.62 
 
 		 423 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  24.62 
 
 		 423 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>