More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0564 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 635 aa  1284    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 632 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 630 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 630 aa  435  1e-120  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 635 aa  430  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 619 aa  422  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 629 aa  424  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 625 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 		 567 aa  278  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 558 aa  276  9e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 574 aa  275  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 566 aa  266  1e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 		 566 aa  261  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 		 566 aa  259  8e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 		 569 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 558 aa  256  9e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 555 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24923  predicted protein  29.34 
 
 		 652 aa  254  3e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.321104  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 		 555 aa  252  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 		 591 aa  246  9e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 550 aa  244  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 		 597 aa  244  5e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 559 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 621 aa  236  7e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 597 aa  236  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  31.55 
 
 		 583 aa  231  4e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 599 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 613 aa  221  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 612 aa  218  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 		 590 aa  217  5e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 592 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 		 642 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 		 565 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 		 566 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 		 565 aa  207  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  28.59 
 
 		 628 aa  206  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 601 aa  206  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 		 574 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 592 aa  206  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 592 aa  206  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  25.94 
 
 		 585 aa  201  3e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 595 aa  199  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 565 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 640 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 593 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 		 624 aa  196  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  27.47 
 
 		 565 aa  195  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 566 aa  192  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 566 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 591 aa  190  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 		 596 aa  189  1e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 563 aa  189  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 		 564 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 		 564 aa  184  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 562 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 613 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 563 aa  182  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 562 aa  182  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 569 aa  182  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 		 581 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 		 562 aa  181  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 		 586 aa  180  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 		 562 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 562 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 		 562 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 		 562 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  26.16 
 
 		 592 aa  179  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 		 562 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 557 aa  178  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  27.96 
 
 		 650 aa  177  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 		 602 aa  177  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 		 628 aa  176  8e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 551 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 		 600 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 556 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 562 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4389  arginyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 		 613 aa  174  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  26.26 
 
 		 562 aa  173  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 581 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 		 571 aa  172  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 		 562 aa  171  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  27.58 
 
 		 581 aa  170  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 581 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 581 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 581 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 581 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  26.41 
 
 		 581 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 581 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 581 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  26.02 
 
 		 563 aa  168  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 581 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 581 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 		 589 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 577 aa  167  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 584 aa  167  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 551 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0153  arginyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 572 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 		 589 aa  166  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  26.16 
 
 		 581 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>