More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1577 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  78.2 
 
 		 629 aa  986    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 635 aa  1279    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  75.47 
 
 		 630 aa  995    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  78.32 
 
 		 632 aa  1054    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 630 aa  541  1e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 635 aa  430  1e-119  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 619 aa  370  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 		 625 aa  333  5e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 		 555 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 558 aa  233  6e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 558 aa  226  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 569 aa  224  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 567 aa  224  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 		 558 aa  221  5e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 583 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 		 591 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24923  predicted protein  27.65 
 
 		 652 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.321104  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 		 559 aa  208  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 555 aa  208  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 612 aa  207  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 566 aa  206  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 566 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  28.96 
 
 		 628 aa  194  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 597 aa  192  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 		 640 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 613 aa  190  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 		 601 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 574 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 		 574 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 590 aa  184  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 		 613 aa  179  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 565 aa  178  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 597 aa  175  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 		 592 aa  174  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  25.83 
 
 		 566 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 		 565 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 595 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  25.83 
 
 		 565 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  27.14 
 
 		 599 aa  164  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  25.14 
 
 		 565 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 		 593 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 566 aa  160  6e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 550 aa  159  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 581 aa  159  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 602 aa  157  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 		 591 aa  157  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 579 aa  156  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 576 aa  156  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 		 564 aa  156  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 		 592 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  25.52 
 
 		 576 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 		 592 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  25.33 
 
 		 576 aa  153  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 582 aa  153  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 		 579 aa  153  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 		 642 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  25.33 
 
 		 576 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 		 578 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 		 599 aa  153  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 577 aa  153  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  25.99 
 
 		 576 aa  153  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 577 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  23.85 
 
 		 566 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  25.33 
 
 		 576 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 600 aa  152  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 621 aa  151  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 		 576 aa  150  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  26.41 
 
 		 563 aa  150  8e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 		 577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  26.81 
 
 		 581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  26.41 
 
 		 563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 		 584 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  24.78 
 
 		 624 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  30.05 
 
 		 571 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 		 628 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 581 aa  148  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 581 aa  148  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 581 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 581 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 581 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 561 aa  147  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 		 577 aa  147  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 563 aa  147  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  26.69 
 
 		 650 aa  147  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 		 581 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 581 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 581 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 581 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  26.19 
 
 		 572 aa  146  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 		 581 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 581 aa  145  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 577 aa  144  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 564 aa  144  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  25.33 
 
 		 578 aa  143  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 		 578 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  23.96 
 
 		 576 aa  143  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 581 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 576 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  25.23 
 
 		 596 aa  142  3e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>