More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0251 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  72.39 
 
 		 592 aa  891    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 596 aa  671    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  53.34 
 
 		 597 aa  667    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 592 aa  1208    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 		 599 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  69.01 
 
 		 597 aa  867    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 621 aa  654    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 592 aa  681    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 		 593 aa  699    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 642 aa  542  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 590 aa  483  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 585 aa  389  1e-107  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 		 601 aa  259  7e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 		 564 aa  244  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 562 aa  243  9e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 562 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 563 aa  236  6e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 562 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 562 aa  236  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 562 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 562 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 562 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 562 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 		 562 aa  232  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 		 574 aa  230  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 		 564 aa  230  7e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 562 aa  229  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 		 624 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 565 aa  228  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 565 aa  227  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 		 563 aa  226  9e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 566 aa  226  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 566 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 571 aa  224  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 635 aa  223  9e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 550 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 566 aa  221  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 565 aa  216  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 		 562 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 574 aa  211  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 572 aa  210  7e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 		 563 aa  207  6e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 640 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 		 566 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 		 566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  29.28 
 
 		 566 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 580 aa  198  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 		 591 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  26.16 
 
 		 555 aa  194  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 591 aa  193  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 		 630 aa  192  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 595 aa  193  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 		 555 aa  190  7e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 		 569 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 		 581 aa  188  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 		 613 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  25.92 
 
 		 603 aa  187  6e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 581 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 579 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 581 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  24.18 
 
 		 585 aa  184  5.0000000000000004e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 581 aa  184  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 581 aa  184  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 581 aa  184  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 583 aa  183  7e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 581 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 576 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 567 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 581 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 581 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 581 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 581 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 		 577 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 		 577 aa  182  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 581 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 558 aa  181  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  26.19 
 
 		 558 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 		 569 aa  180  8e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 581 aa  179  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 598 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0630  arginyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 		 593 aa  179  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 		 602 aa  179  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 		 599 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 577 aa  178  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 581 aa  178  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 		 581 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 613 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0153  arginyl-tRNA synthetase  25.12 
 
 		 572 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 		 581 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1274  arginyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 		 594 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000144018  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  25.59 
 
 		 630 aa  173  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 		 577 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  24.96 
 
 		 575 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 559 aa  173  9e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 		 632 aa  172  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 577 aa  172  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 577 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  26.61 
 
 		 577 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>