More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2323 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  66.78 
 
 		 563 aa  791    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 564 aa  1146    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  59.04 
 
 		 564 aa  677    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  56.89 
 
 		 563 aa  649    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  64.96 
 
 		 563 aa  774    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 562 aa  623  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 562 aa  623  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 562 aa  622  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 562 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 562 aa  619  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 562 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 562 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 562 aa  617  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 562 aa  617  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 562 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 562 aa  599  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 566 aa  588  1e-166  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 566 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 565 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 565 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 566 aa  512  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 565 aa  512  1e-144  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 624 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 565 aa  486  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 580 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 574 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 572 aa  372  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 640 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 603 aa  369  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 613 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 		 571 aa  354  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 591 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 585 aa  347  5e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 576 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4156  arginyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 581 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204707  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  34.46 
 
 		 650 aa  320  3.9999999999999996e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 581 aa  318  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 		 590 aa  313  7.999999999999999e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 		 590 aa  312  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 576 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 579 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 		 576 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 576 aa  307  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 576 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 577 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 576 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 581 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 581 aa  302  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 577 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 575 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 577 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 576 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 585 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 581 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  35.38 
 
 		 622 aa  300  4e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 576 aa  300  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 578 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 581 aa  300  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 581 aa  300  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 576 aa  300  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 		 578 aa  299  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 578 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 581 aa  299  9e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 581 aa  299  9e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 578 aa  299  9e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 581 aa  299  9e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 581 aa  299  9e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 581 aa  299  9e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 581 aa  299  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27471  arginyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 		 603 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 578 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 574 aa  297  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  33.28 
 
 		 577 aa  297  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 579 aa  296  9e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 578 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2060  arginyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 585 aa  295  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3561  arginyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 588 aa  294  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515123 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 577 aa  294  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 		 579 aa  294  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 581 aa  293  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 577 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 577 aa  293  6e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 577 aa  293  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  35.33 
 
 		 577 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 		 581 aa  293  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 577 aa  292  9e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0630  arginyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 593 aa  292  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 		 577 aa  292  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 		 578 aa  291  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 		 599 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 577 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 577 aa  290  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 581 aa  290  6e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 577 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 577 aa  290  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>