More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3474 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 580 aa  1172    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 566 aa  507  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 562 aa  458  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 565 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 565 aa  458  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 562 aa  458  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 562 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 562 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 562 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 562 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 562 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 562 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 562 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 562 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 566 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 563 aa  424  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 624 aa  422  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 563 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 565 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 566 aa  415  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 564 aa  408  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 564 aa  404  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 563 aa  404  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 565 aa  394  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 433 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 562 aa  362  8e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 574 aa  360  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 572 aa  348  1e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 640 aa  333  5e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 579 aa  328  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 613 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 		 571 aa  317  3e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 603 aa  310  4e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 581 aa  306  6e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 581 aa  302  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 577 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 576 aa  300  5e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 581 aa  300  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 581 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 581 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 581 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 591 aa  299  9e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 581 aa  299  9e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 581 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 581 aa  297  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 581 aa  297  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 576 aa  297  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 		 578 aa  296  9e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 576 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 581 aa  293  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 576 aa  293  6e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  34 
 
 		 582 aa  291  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 579 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 576 aa  286  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 576 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 581 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 		 576 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 		 585 aa  284  3.0000000000000004e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 581 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 		 578 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 578 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 578 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 578 aa  280  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 		 577 aa  280  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2566  arginyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 590 aa  279  9e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 575 aa  279  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5574  arginyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 619 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  0.593378 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 577 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 577 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 577 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 579 aa  277  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 		 585 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 577 aa  276  7e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 577 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 577 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 		 576 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 		 577 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02161  arginyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 		 602 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 		 576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5788  arginyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66750  arginyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3151  arginyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 577 aa  274  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 577 aa  274  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 577 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02051  arginyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 603 aa  274  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 		 577 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 599 aa  274  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 		 576 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 		 578 aa  273  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 577 aa  273  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 577 aa  273  9e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 577 aa  273  9e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 590 aa  273  9e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  33.69 
 
 		 577 aa  273  9e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 578 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36013  predicted protein  33.56 
 
 		 573 aa  272  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>