More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1215 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 
563 aa  667    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  56.89 
 
 
564 aa  649    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 
566 aa  655    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 
564 aa  671    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
563 aa  1153    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 
563 aa  655    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
562 aa  627  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 
562 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 
562 aa  624  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 
562 aa  622  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 
562 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 
562 aa  621  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 
562 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 
562 aa  618  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 
562 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 
562 aa  614  9.999999999999999e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 
562 aa  608  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
566 aa  538  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 
566 aa  531  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
565 aa  529  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
565 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 
433 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  46 
 
 
565 aa  487  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
624 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
565 aa  463  1e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
580 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 
603 aa  356  5e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
572 aa  347  4e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
640 aa  340  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
571 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
613 aa  334  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 
574 aa  331  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 
591 aa  303  7.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 
590 aa  302  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  33.95 
 
 
622 aa  298  2e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  32.52 
 
 
650 aa  297  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 
579 aa  290  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 
585 aa  284  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 
578 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 
579 aa  266  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 
579 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2566  arginyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 
590 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
581 aa  263  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 
576 aa  263  8e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
578 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
578 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 
581 aa  259  7e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 
576 aa  259  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 
578 aa  259  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
590 aa  259  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 
581 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 
581 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
581 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 
581 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 
578 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27471  arginyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 
603 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 
576 aa  257  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02051  arginyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 
603 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0153  arginyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 
572 aa  256  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
581 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36013  predicted protein  32.31 
 
 
573 aa  254  3e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 
577 aa  254  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 
585 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 
581 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 
581 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
578 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 
576 aa  253  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 
577 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
581 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
577 aa  253  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 
578 aa  253  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
581 aa  253  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0146  arginyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 
572 aa  253  8.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
577 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
577 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  32.1 
 
 
577 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
577 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
577 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 
576 aa  252  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
581 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
581 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
581 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
598 aa  252  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
577 aa  252  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
577 aa  252  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 
576 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 
574 aa  252  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
577 aa  251  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 
576 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 
582 aa  251  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 
577 aa  249  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
576 aa  249  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 
582 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
576 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 
577 aa  248  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 
577 aa  247  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2451  arginyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 
590 aa  247  4e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02621  arginyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 
607 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0249545  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 
577 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 
577 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>