More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1309 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  91.84 
 
 		 640 aa  1148    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 574 aa  735    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 613 aa  1240    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 		 591 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 576 aa  493  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 566 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 		 566 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 		 624 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 565 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  38.47 
 
 		 565 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 562 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 562 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 562 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 562 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 562 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 562 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 571 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 562 aa  369  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 562 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 564 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 562 aa  362  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 563 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 577 aa  353  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 572 aa  353  5.9999999999999994e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 577 aa  351  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 599 aa  350  3e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 565 aa  350  5e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 577 aa  349  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 563 aa  348  1e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 577 aa  346  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 577 aa  346  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 577 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 577 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 577 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 562 aa  345  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 563 aa  344  2.9999999999999997e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 577 aa  343  5.999999999999999e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 577 aa  342  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 577 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 577 aa  342  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 577 aa  342  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  37 
 
 		 577 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 577 aa  342  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 577 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 577 aa  340  4e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 577 aa  339  8e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 566 aa  338  1.9999999999999998e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 576 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 576 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 598 aa  326  7e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 576 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 576 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 580 aa  323  5e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 576 aa  323  6e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 577 aa  322  9.999999999999999e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 		 565 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 585 aa  320  5e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 576 aa  320  6e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 581 aa  318  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 581 aa  317  5e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 576 aa  317  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 		 564 aa  317  5e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 576 aa  317  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 581 aa  316  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 581 aa  316  8e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1338  arginyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 660 aa  315  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 581 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0276  arginyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 578 aa  315  1.9999999999999998e-84  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 581 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 		 579 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 581 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 581 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 581 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 581 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 581 aa  309  9e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 581 aa  307  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 581 aa  306  6e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 		 581 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 581 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 562 aa  303  5.000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3151  arginyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 585 aa  302  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 581 aa  300  5e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 579 aa  300  7e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5574  arginyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 619 aa  299  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  0.593378 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 433 aa  299  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 574 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66750  arginyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 587 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0630  arginyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 593 aa  296  7e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5788  arginyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 587 aa  296  8e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 578 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 582 aa  296  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 578 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 578 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 578 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 578 aa  293  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3277  arginyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 570 aa  290  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431918  normal  0.529534 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 		 578 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>