More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0376 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 
581 aa  768    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  97.17 
 
 
578 aa  1137    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  65.07 
 
 
581 aa  758    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 
581 aa  769    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  65.87 
 
 
581 aa  773    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  85.29 
 
 
578 aa  1017    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  79.15 
 
 
579 aa  923    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  77.21 
 
 
579 aa  906    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  85.15 
 
 
579 aa  984    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  64.84 
 
 
581 aa  759    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  86.37 
 
 
578 aa  1025    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
578 aa  1189    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 
581 aa  768    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  64.15 
 
 
581 aa  751    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  62.26 
 
 
582 aa  752    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  96.46 
 
 
578 aa  1126    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  63.81 
 
 
581 aa  749    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 
577 aa  640    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  65.18 
 
 
581 aa  768    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  65.18 
 
 
581 aa  768    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  64.38 
 
 
581 aa  752    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66750  arginyl-tRNA synthetase  77.68 
 
 
587 aa  904    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 
581 aa  768    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 
581 aa  771    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  65.01 
 
 
581 aa  766    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  96.99 
 
 
578 aa  1134    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5788  arginyl-tRNA synthetase  77.68 
 
 
587 aa  901    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  63.12 
 
 
581 aa  749    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  65.35 
 
 
581 aa  769    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 
576 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 
577 aa  629  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
576 aa  628  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
576 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
576 aa  625  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
576 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 
576 aa  621  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 
576 aa  622  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 
577 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 
577 aa  620  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 
576 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
577 aa  621  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 
577 aa  620  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 
577 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 
577 aa  620  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 
576 aa  619  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 
577 aa  620  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  55.67 
 
 
577 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 
577 aa  617  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  55.34 
 
 
577 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 
599 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 
578 aa  616  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 
577 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 
577 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 
577 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 
577 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 
577 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 
577 aa  608  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  55.54 
 
 
577 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 
577 aa  601  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 
579 aa  595  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 
582 aa  560  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0276  arginyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
578 aa  556  1e-157  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 
590 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3238  arginyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 
585 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3561  arginyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
588 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
585 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
598 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0542  arginyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
585 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475442  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0525  arginyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
585 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2060  arginyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
585 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
576 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5574  arginyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
619 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  0.593378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3277  arginyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 
570 aa  472  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431918  normal  0.529534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3985  arginyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
585 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
575 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4156  arginyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
581 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204707  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02621  arginyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
607 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0249545  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27471  arginyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
603 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1554  arginyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
607 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
574 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0189  arginyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
604 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.177771  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02051  arginyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
603 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0630  arginyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 
593 aa  460  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8944  Arginine--tRNA ligase  44.42 
 
 
584 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2451  arginyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
590 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02071  arginyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
604 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02051  arginyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
604 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36013  predicted protein  44.31 
 
 
573 aa  450  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02161  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
602 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0739  arginyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
563 aa  444  1e-123  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0146  arginyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 
572 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
585 aa  442  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0153  arginyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
572 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2134  arginyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
590 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3151  arginyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 
585 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06550  arginyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
588 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.386576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
571 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
572 aa  384  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119542  arginyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
600 aa  382  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317738  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2566  arginyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
590 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>