More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1335 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
565 aa  1149    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 
566 aa  667    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 
565 aa  595  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 
565 aa  596  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
564 aa  527  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
563 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
564 aa  515  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
563 aa  509  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
562 aa  500  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
562 aa  500  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
562 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
562 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
562 aa  495  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
562 aa  495  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
562 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
566 aa  498  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
562 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
562 aa  491  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
562 aa  491  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
624 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
562 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
565 aa  482  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
563 aa  473  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
566 aa  460  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
433 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
580 aa  395  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
571 aa  385  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
572 aa  368  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 
574 aa  364  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
585 aa  350  4e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
603 aa  349  9e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.908762 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  33.6 
 
 
650 aa  343  5.999999999999999e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
640 aa  329  9e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 
613 aa  323  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
576 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 
590 aa  307  3e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
576 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 
576 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  33.84 
 
 
622 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 
577 aa  298  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 
585 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
577 aa  294  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
577 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
577 aa  293  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
577 aa  293  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
577 aa  294  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  33.76 
 
 
577 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
577 aa  294  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
577 aa  293  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  34 
 
 
577 aa  293  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
576 aa  293  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 
576 aa  293  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
599 aa  293  8e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
577 aa  293  8e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
577 aa  293  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 
577 aa  292  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 
576 aa  292  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 
577 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
577 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
577 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 
576 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 
577 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 
576 aa  289  9e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 
576 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 
575 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 
577 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 
579 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 
577 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 
577 aa  288  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 
578 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
590 aa  284  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 
576 aa  282  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
582 aa  280  7e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3238  arginyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
585 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0276  arginyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
578 aa  275  1.0000000000000001e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 
576 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3561  arginyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
588 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515123 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0189  arginyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 
604 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.177771  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3985  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
585 aa  273  5.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 
581 aa  273  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36013  predicted protein  31.99 
 
 
573 aa  273  7e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02071  arginyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 
604 aa  273  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 
579 aa  273  8.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 
581 aa  272  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02621  arginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
607 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0249545  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
581 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 
582 aa  270  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 
581 aa  269  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 
598 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 
581 aa  269  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  31.49 
 
 
581 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
581 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
581 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 
578 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
581 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 
550 aa  267  4e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8944  Arginine--tRNA ligase  31.02 
 
 
584 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02051  arginyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 
603 aa  266  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  32.34 
 
 
579 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>