More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0466 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 		 563 aa  671    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 		 562 aa  642    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  59.04 
 
 		 564 aa  677    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 564 aa  1150    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 563 aa  671    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 		 563 aa  672    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 		 562 aa  633  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 562 aa  634  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  57.06 
 
 		 562 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 562 aa  631  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 		 562 aa  629  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 562 aa  631  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 562 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 		 562 aa  615  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 562 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 562 aa  585  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 566 aa  576  1.0000000000000001e-163  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 566 aa  548  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 565 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 565 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 566 aa  541  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 565 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 624 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 565 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 580 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 603 aa  338  9.999999999999999e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 571 aa  336  9e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 572 aa  335  1e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 574 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 640 aa  319  7.999999999999999e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 613 aa  309  9e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 585 aa  302  1e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 591 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06368  arginyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G14030)  30.42 
 
 		 650 aa  294  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02051  arginyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 603 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 579 aa  281  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 590 aa  280  4e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2566  arginyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 590 aa  279  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 576 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  34.16 
 
 		 622 aa  273  8.000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 578 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 585 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 574 aa  270  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 576 aa  270  5e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 581 aa  270  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 		 581 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 590 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 		 581 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 		 581 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3561  arginyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 588 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515123 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27471  arginyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 603 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 		 578 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 550 aa  265  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 581 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 581 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 581 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 581 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  32.01 
 
 		 581 aa  262  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02161  arginyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 		 602 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 		 581 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 		 582 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 		 592 aa  260  4e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 		 578 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 		 578 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 597 aa  259  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 578 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 576 aa  257  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02071  arginyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 		 604 aa  256  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4156  arginyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 581 aa  256  9e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 577 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 579 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02621  arginyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 		 607 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0249545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 		 579 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 581 aa  254  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02051  arginyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 		 604 aa  254  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 582 aa  253  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 		 581 aa  253  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  32.01 
 
 		 578 aa  253  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0542  arginyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 585 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  31.52 
 
 		 578 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 598 aa  252  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0146  arginyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 		 572 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0525  arginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 585 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3985  arginyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 		 585 aa  252  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0153  arginyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 		 572 aa  252  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 576 aa  253  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  30.87 
 
 		 577 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1554  arginyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 607 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 		 576 aa  249  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2060  arginyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 		 585 aa  249  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 		 575 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0189  arginyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 604 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.177771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66750  arginyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 587 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 		 577 aa  247  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 576 aa  247  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>