More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0186 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 597 aa  1223    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0251  arginyl-tRNA synthetase  68.68 
 
 		 592 aa  846    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 597 aa  669    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 593 aa  692    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0599  arginyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 596 aa  660    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 621 aa  675    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  69.46 
 
 		 592 aa  863    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 599 aa  653    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 592 aa  655    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6433  arginyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 		 642 aa  593  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 590 aa  478  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0607  arginyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 585 aa  382  1e-104  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.872641  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 564 aa  259  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 		 601 aa  258  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 624 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 		 635 aa  244  5e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 564 aa  239  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  26.21 
 
 		 640 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  25.86 
 
 		 574 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 565 aa  232  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 563 aa  231  4e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 565 aa  229  8e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 		 563 aa  228  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 566 aa  227  6e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 566 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 562 aa  226  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 550 aa  225  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 562 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 565 aa  224  3e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 562 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 		 562 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 613 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 558 aa  223  7e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 562 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 562 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 562 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 562 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 		 562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 591 aa  215  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 		 566 aa  214  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 		 562 aa  209  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 562 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 572 aa  207  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 		 571 aa  205  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 		 555 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2236  arginyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 433 aa  200  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000339277  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  26.07 
 
 		 563 aa  200  7e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 		 558 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 566 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 574 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 		 566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4133  arginyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 		 576 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 		 580 aa  198  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 630 aa  197  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 591 aa  196  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 566 aa  192  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 		 569 aa  190  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 598 aa  188  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 		 558 aa  188  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 567 aa  187  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 559 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 569 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 		 595 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38727  arginyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 		 603 aa  185  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.908762 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 		 583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01310  arginine-tRNA ligase, putative  28.2 
 
 		 622 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0173932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1274  arginyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 594 aa  184  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000144018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8944  Arginine--tRNA ligase  25.74 
 
 		 584 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0153  arginyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 		 572 aa  183  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 602 aa  182  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 		 632 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 575 aa  180  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 		 628 aa  179  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 613 aa  177  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  25.47 
 
 		 619 aa  175  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 635 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 		 628 aa  174  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 		 612 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 		 581 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  24.3 
 
 		 585 aa  174  5.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 		 629 aa  173  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  25.82 
 
 		 574 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 630 aa  173  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  24.84 
 
 		 579 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0146  arginyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 		 572 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3151  arginyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 		 585 aa  171  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  24.74 
 
 		 581 aa  170  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4156  arginyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 		 581 aa  169  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  24.41 
 
 		 581 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  24.41 
 
 		 581 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0525  arginyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 		 585 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  24.41 
 
 		 581 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  24.53 
 
 		 581 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  24.66 
 
 		 581 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0542  arginyl-tRNA synthetase  25.97 
 
 		 585 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 		 579 aa  166  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  26 
 
 		 590 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4389  arginyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 		 613 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.872152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>