More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1036 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 628 aa  1278    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 612 aa  619  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 613 aa  607  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2032  arginyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 		 647 aa  292  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 628 aa  286  8e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  28.59 
 
 		 569 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 555 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 		 555 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 		 569 aa  252  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 566 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 566 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 566 aa  243  6e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 		 558 aa  241  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  30.51 
 
 		 558 aa  234  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 		 574 aa  234  5e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 558 aa  233  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  29.28 
 
 		 550 aa  229  9e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 		 559 aa  229  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 		 567 aa  225  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  28.59 
 
 		 635 aa  206  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 595 aa  202  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 572 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 		 632 aa  201  3e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 591 aa  200  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 619 aa  200  7e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3474  arginyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 580 aa  199  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387689  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 565 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 		 583 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  28.55 
 
 		 565 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 613 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 630 aa  196  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 563 aa  195  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  28.96 
 
 		 635 aa  194  4e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 		 624 aa  194  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 		 566 aa  193  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 		 599 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 		 565 aa  190  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  25.36 
 
 		 566 aa  190  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 		 625 aa  188  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 640 aa  188  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 574 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 600 aa  187  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 562 aa  187  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 602 aa  186  8e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 564 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 		 562 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 		 562 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 562 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 562 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 601 aa  181  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 564 aa  180  7e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1270  arginyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 		 562 aa  179  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000463651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 		 562 aa  177  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 		 576 aa  177  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 		 562 aa  177  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  27.55 
 
 		 562 aa  177  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 576 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 		 565 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 		 597 aa  174  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 576 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  26.35 
 
 		 576 aa  174  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 566 aa  174  5.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  23.83 
 
 		 571 aa  173  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  26.19 
 
 		 576 aa  173  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 576 aa  172  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 		 576 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 562 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 592 aa  169  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0267  arginyl-tRNA synthetase  25.67 
 
 		 597 aa  168  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  25.69 
 
 		 621 aa  169  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 563 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 629 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 630 aa  167  6.9999999999999995e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 		 591 aa  166  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 576 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 		 576 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  27 
 
 		 581 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 577 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 		 563 aa  164  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 577 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 577 aa  164  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 577 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 577 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  27 
 
 		 577 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 577 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  27 
 
 		 577 aa  163  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  27 
 
 		 577 aa  163  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 577 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 577 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 577 aa  162  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 577 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  27.29 
 
 		 577 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  25.98 
 
 		 581 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 577 aa  161  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  26.66 
 
 		 590 aa  160  9e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 581 aa  158  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 		 592 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  25.73 
 
 		 579 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 579 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>